非コード領域構造変異に重点をおく稀少遺伝性疾患の遺伝要因と分子病態の解明

• Project/Area Number: 23K27568
• Project/Area Number (Other): 23H02877 (2023)
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund (2024); Single-year Grants (2023)
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 52050:Embryonic medicine and pediatrics-related
• Research Institution: Yokohama City University
• Principal Investigator: 水口 剛 横浜市立大学, 医学部, 准教授 (90404996)
• Project Period (FY): 2023-04-01 – 2026-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥18,850,000 (Direct Cost: ¥14,500,000、Indirect Cost: ¥4,350,000); Fiscal Year 2025: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000); Fiscal Year 2024: ¥6,630,000 (Direct Cost: ¥5,100,000、Indirect Cost: ¥1,530,000); Fiscal Year 2023: ¥7,020,000 (Direct Cost: ¥5,400,000、Indirect Cost: ¥1,620,000)
• Keywords: ロングリードシーケンス / リピート伸長 / ゲノム構造異常 / 希少疾患 / オミクス

Outline of Research at the Start

ロングリードシーケンサーの発展によりゲノム構造変異・リピート伸長変異の検出が全ゲノムレベルで可能となった。このような変異の中でタンパク質コード領域変異は直接的な遺伝子構造破壊により疾患の原因となりうるが、非コードDNA領域に位置した場合、ゲノム配列情報のみで病態への関与を証明することは困難である。本研究ではショートリードシーケンス解析で未解決の遺伝性疾患を対象に、ロングリードを駆使したオミクス解析を行い、全ゲノム構造変異・リピート伸長変異プロファイルと突合させることで疾患原因となる非コードDNA領域構造変異・リピート伸長変異の病態への寄与を検証する。