Elucidation of atopic dermatitis pathology through nucleic acid-independent single-cell microbiome analysis

• Project/Area Number: 23K27621
• Project/Area Number (Other): 23H02930 (2023)
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund (2024); Single-year Grants (2023)
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 53050:Dermatology-related
• Research Institution: Osaka University
• Principal Investigator: 松岡 悠美 大阪大学, 免疫学フロンティア研究センター, 教授 (10402067)
• Project Period (FY): 2023-04-01 – 2026-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥18,720,000 (Direct Cost: ¥14,400,000、Indirect Cost: ¥4,320,000); Fiscal Year 2025: ¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000); Fiscal Year 2024: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000); Fiscal Year 2023: ¥7,930,000 (Direct Cost: ¥6,100,000、Indirect Cost: ¥1,830,000)
• Keywords: 皮膚細菌叢 / アトピー性皮膚炎 / ナノポア / artificial intelligence / 細菌叢 / シングルセル

Outline of Research at the Start

皮膚常在微生物のバランスの破綻は、アトピー性皮膚炎(Atopic dermatitis, AD)を始めとする様々な炎症性皮膚疾患の病態に関与している。AD発症期のこの中で、皮膚細菌叢解析と、病原微生物のクオラムセンシングの状態をシングルセルレベルで同時にかつ迅速に観測できるようになれば、宿主環境との相互作用を明らかにでき、さらなる病態解明につながる。そこで本課題では、ナノポアによる微生物識別とAI学習により、微生物が「真に病原性を発揮している細菌叢内の微生物」であるかを瞬時に判定できる技術基盤を皮膚を場として確立する。