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The role of riboflavin metabolites in regulating adipocyte plasticity

Research Project

Project/Area Number 23K28002
Project/Area Number (Other) 23H03312 (2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2023)
Section一般
Review Section Basic Section 59040:Nutrition science and health science-related
Research InstitutionKumamoto University

Principal Investigator

日野 信次朗  熊本大学, 発生医学研究所, 准教授 (00448523)

Project Period (FY) 2023-04-01 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥18,980,000 (Direct Cost: ¥14,600,000、Indirect Cost: ¥4,380,000)
Fiscal Year 2025: ¥5,590,000 (Direct Cost: ¥4,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000)
Fiscal Year 2024: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2023: ¥8,190,000 (Direct Cost: ¥6,300,000、Indirect Cost: ¥1,890,000)
Keywordsリボフラビン / エピゲノム / 脂肪細胞 / ビタミン / クロマチン / 遺伝子発現 / 脂肪組織
Outline of Research at the Start

様々な栄養素がDNAメチル化やヒストン修飾等のエピゲノムの形成を介して遺伝子発現制御に関わる。必須栄養素であるリボフラビン(Rf、ビタミンB2)は多様な細胞機能に関わるが、摂取量の多寡が長期的な体質(表現型)形成や疾患リスクに及ぼす影響はわかっていない。本研究では、Rfがエピゲノム形成を介して脂肪組織可塑性や代謝恒常性に寄与する仕組みを解明し、その健康寿命における役割を検証する。本研究では、多層オミクス解析による新規メカニズム解明と、遺伝子改変マウスを用いたRfの生理作用の解明を目指す。本研究により、Rfの栄養素としての役割を再定義し、健康増進への活用の道を拓く。

Outline of Annual Research Achievements

様々な栄養素がDNAメチル化やヒストン修飾等のエピゲノムの形成を介して遺伝子発現制御に関わる。必須栄養素であるリボフラビン(Rf、ビタミンB2)は多様な細胞機能に関わるが、摂取量の多寡が長期的な体質(表現型)形成や疾患リスクに及ぼす影響はわかっていない。また、Rfは多様な細胞内経路を介してエピゲノム形成に関わる可能性がある。そこで、Rf依存性転写・エピゲノム制御に焦点を当て、その分子機序と代謝恒常性における役割を明らかにすることを目的として研究を進めている。本課題は、代表者らが独自に作製した組織特異的Rf代謝不全マウスを用いた多層オミクス解析や、培養細胞を用いた分子機能解析を基盤として進めている。本年度の研究では、ATAC-seq法によりRf依存性クロマチン構造変化の全体像を明らかにし、Rfシグナルの下流で働きうる転写制御因子の候補をリストアップすることができた。また、脂肪細胞で高発現しその機能制御に関わるRf依存性タンパク質(フラボタンパク質)を同定することが出来た。これらの成果から、Rfによる脂肪細胞分化制御、さらにはRf利用性と脂肪貯蔵、消費、熱産生といった細胞機能との関わりを明らかにすることが出来た。次年度以降は、Rf依存性タンパク質や代謝物の分子機能の詳細解明を目指す。本研究は、個々の栄養素がどのようにしてその生理活性を発揮するかを明らかにするものであり、今後様々な栄養素や機能性食品成分の研究への応用基盤を生み出す。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

脂肪細胞機能制御に関わるフラボタンパク質を同定することが出来、Rf依存性クロマチン構造形成の全体像を掴むことが出来た。いずれも2023年度に計画していた内容であるため、進捗は順調と言える。

Strategy for Future Research Activity

上記の進捗状況を踏まえて、今後はフラボタンパク質やその代謝産物の機能解析、Rf依存性クロマチン構造制御に関わる核内因子の機能解析を行う。
【フラボタンパク質による脂肪細胞制御機序の解明】 前年度の研究で、脂肪組織において高発現するRf依存性タンパク質(フラボタンパク質、FP-A)を同定し、その下流で生成される代謝物が脂肪細胞制御に関わることを見出した。そこで本年度以降の研究では、FP-Aの生理機能の詳細を明らかにする目的で遺伝子欠損マウスを作製し、表現型解析や遺伝子発現・エピゲノム解析を実施する。また、FP-A依存的に生成される代謝物による脂肪細胞制御に介在する分子を同定する目的で、網羅的プロテオーム・エピゲノム解析を実施する他、機能スクリーニング系を構築する。
【Rf依存性エピゲノム制御機構の解明】 前年度にRf代謝不全マウス組織を用いてATAC-seq解析を行い、Rf依存的なクロマチン構造制御を受けるゲノム領域を同定し、その制御分子の候補を見出した。本年度以降は、これら分子の機能解析を実施して新規のRf依存性エピゲノム制御機構を明らかにする。一方で、脂肪組織内には多様な細胞種が存在するため、Rf依存性分子メカニズムを正確に理解するためには、Rf代謝不全を来した細胞種のみを解析する必要がある。そこで、一細胞解析や細胞種毎に分画した網羅的クロマチン・エピゲノム解析を実施する。
【Rf及びRf依存性代謝物による健康増進の可能性】 Rf及びRf代謝の下流で生成される代謝物が、成長促進や加齢・代謝疾患の予防・治療に応用できるか検証する。

Report

(1 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2024 2023 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results) (of which Invited: 3 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] ケルン大学(ドイツ)

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  • [Journal Article] YAP/BRD4‐controlled ROR1 promotes tumor‐initiating cells and hyperproliferation in pancreatic cancer2023

    • Author(s)
      Yamazaki Masaya、Hino Shinjiro、Usuki Shingo、Miyazaki Yoshihiro、Oda Tatsuya、Nakao Mitsuyoshi、Ito Takaaki、Yamagata Kazuya
    • Journal Title

      The EMBO Journal

      Volume: 42 Issue: 14

    • DOI

      10.15252/embj.2022112614

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  • [Journal Article] ミトコンドリアから細胞核への逆行性シグナルによるエンハンサーリモデリング2023

    • Author(s)
      日野裕子、日野信次朗、中尾光善
    • Journal Title

      医学のあゆみ

      Volume: 286 Pages: 171-172

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    • Author(s)
      日野信次朗
    • Organizer
      北海道大学遺伝子病制御研究センターセミナー
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    • Invited
  • [Presentation] フラビン依存性ヒストン脱メチル化酵素による環境適応の制御2023

    • Author(s)
      日野信次朗
    • Organizer
      第96回日本生化学会大会(シンポジウム:細胞内ケミカルネットワークの解明と創出)
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    • Invited
  • [Presentation] ヒストン脱メチル化酵素LSD1による骨格筋環境応答の調節2023

    • Author(s)
      日野信次朗
    • Organizer
      日本体力医学会特別大会(シンポジウム:運動応答臓器におけるエピジェネティクス制御の最前線)
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      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Remarks] 熊本大学発生医学研究所HP

    • URL

      https://www.imeg.kumamoto-u.ac.jp

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  • [Remarks] 熊大通信

    • URL

      https://www.kumamoto-u.ac.jp/daigakujouhou/kouhou/kouhoushi/kumatu/vol-90

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Published: 2023-04-18   Modified: 2024-12-25  

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