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軟X線XAFS・ラマン同時測定による溶液試料の構造解析法開発と生体分子への展開

Research Project

Project/Area Number 23K28358
Project/Area Number (Other) 23H03669 (2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2023)
Section一般
Review Section Basic Section 80040:Quantum beam science-related
Research InstitutionNational Institutes for Quantum Science and Technology

Principal Investigator

佐伯 盛久  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 高崎量子技術基盤研究所 先端機能材料研究部, 上席研究員 (30370399)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 中林 孝和  東北大学, 薬学研究科, 教授 (30311195)
藤井 健太郎  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 量子生命科学研究所, チームリーダー (00360404)
中西 隆造  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 高崎量子技術基盤研究所 先端機能材料研究部, 主幹研究員 (70447324)
Project Period (FY) 2023-04-01 – 2027-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥18,850,000 (Direct Cost: ¥14,500,000、Indirect Cost: ¥4,350,000)
Fiscal Year 2026: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2025: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2024: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Fiscal Year 2023: ¥10,010,000 (Direct Cost: ¥7,700,000、Indirect Cost: ¥2,310,000)
Keywords軟X線XAFS分光 / ラマン分光 / 溶液中生体試料その場構造解析 / 含硫黄タンパク質 / NanoTerasu / 軟X線・テンダーX線XAFS / He大気圧XAFS装置 / 溶液生体試料 / その場構造解析 / 硫黄含生体分子
Outline of Research at the Start

生体分子研究では水溶液中試料をあるがままの状態で観察し、かつ局所的な構造情報を得る技術が必要であり、X線吸収微細構造(XAFS)分光はこれに適している。しかし、XAFS分光は化学結合に関与しない内殻電子励起を利用するので、結合長の微妙な変化には鈍感である。 一方、同じく溶液中生体分子観察に利用できるラマン分光は、結合長の僅かな変化を反映してスペクトルが変化するので、反応に伴う構造変化が検出できる。本課題ではXAFSとラマンの特長を相補的に利用した分光装置を製作し、NanoTerasuに設置して、特に硫黄原子を含む生体分子(超硫黄分子やSOD1タンパク質など)の構造解析を行うことを目指す。

Outline of Annual Research Achievements

2024年度から稼働した放射光施設ナノテラスでは、高エネルギー分解能を備えた軟X線・テンダーX線ビームを発生できることから、生体分子の構造解析が可能なX線吸収分光装置の整備が求められている。生体分子では溶液中においてその機能を発現するものが多く、その反応機構を明らかにするには、溶液中の試料を「あるがままの状態」で構造解析する技術が必要である。X線吸収微細構造(XAFS)分光はこの目的に適した手法であるが、XAFS分光では化学結合に関与しない内殻電子励起を利用するため、結合長の微妙な変化には鈍感である。一方、同じく溶液中生体分子観察に利用されるラマン分光は、結合長の僅かな変化を反映してスペクトルが変化するので、反応に伴う微妙な構造変化を検出できる。そこで本課題ではXAFS分光とラマン分光の特長を相補的に利用したテンダーX線XAFS+ラマン同時計測装置を製作し、特に複数の硫黄原子が連結した polysulfide-(S)n-を含む生体分子(超硫黄分子やSOD1タンパク質など)を対象とした構造解析法を開発し、ナノテラスで活用することを目指す。
S K吸収端(2.47 keV)付近でのXAFS測定は大気吸収による入射X線減衰を避けるため、通常真空環境下で行われるが、真空中での溶液試料の取り扱いは難しい。そこで令和5年度は、He大気圧環境下(2 keV以上のテンダーX線をほぼ透過)でのXAFS測定ができ、かつ溶液試料の取り扱いも容易な、He大気圧XAFS測定装置の設計を進めた。そして、①XAFS+ラマン同時測定用の溶液試料セルを開発し、既存放射光施設での試験を進めるとともに、②多硫化物やSOD1タンパク質などで、適切な試料条件調整(濃度・サンプル量)により溶液試料のXAFSスペクトルを感度よく測定することに成功し、③独自のHe大気圧XAFS測定装置の設計も進めた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本課題では、硫黄を含む生体分子溶液試料のその場構造解析法の構築に向け、He大気圧XAFS装置を利用したS K端XAFS+ラマン同時計測装置を開発する。この目的に向けて、①XAFS+ラマン同時測定用の溶液試料セルの開発、②He大気圧XAFS装置での硫黄を含む生体分子水溶液の基礎データ取得、③He環境でのS K端XAFS+ラマン同時測定装置の独自製作、の項目に分けて開発を進める。令和5年度は①溶液試料セルの開発を進め、②多硫化物など水溶液試料でのS K端XAFSデータ取得にも成功し、③装置製作に必要な測定機器(He濃度モニターやファイバーラマン分光器)の準備も進めた。①ー③のすべての項目について進展があり、研究計画は順調に進んでいると評価した。

Strategy for Future Research Activity

本課題では、硫黄を含む生体分子溶液試料のその場構造解析法の構築に向け、He大気圧XAFS装置を利用したS K端XAFS+ラマン同時計測装置を開発する。この目的に向けて、①XAFS+ラマン同時測定用の溶液試料セルの開発、②He大気圧XAFS装置での硫黄を含む生体分子水溶液の基礎データ取得、③He環境でのS K端XAFS+ラマン同時測定装置の独自製作、の項目に分けて開発を進める。令和5年度の進捗状況を踏まえ、それぞれの項目に関する推進方策を、以下に記述する。
①令和5年度は、表面からX線を、背面からレーザー照射することにより、XAFSとラマンが同時に測定できる溶液試料セルを設計し、試作品での試験を進めた。今後は、試験結果を踏まえた溶液試料セルの改良を進める。
②生体水溶液試料のXAFS実験を進めるにあたり、S/B比の高いS K端XAFSスペクトルを得るにはどの程度の濃度が必要か、連結する硫黄数-(S)n-によりスペクトルの形状がどのように変化するか、などの情報が必要となる。そこで、令和5年度はあいちシンクロトロン光センターに設置されているHe大気圧XAFS装置において、エネルギー分解能の低い分光結晶InSb(111)を利用して多硫化物など溶液試料での基礎データを取得してきた。今後は、よりエネルギー分解能の高い分光結晶Si(111)での基礎データを取得を進める。
③あいちシンクロトロン光センターの装置情報を参考に、ファイバーラマンを組み込んだHe大気圧XAFS装置を設計・製作する。令和5年度は、本研究予算でファイバーラマンを購入し、その動作試験を行った。今後は、XAFS測定に必要なチェンバーや計測機器の準備を進め、我々独自に製作したHe大気圧XAFS+ラマン同時測定装置の試験を進める。

Report

(1 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2023 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Incorporation of a bromine atom into DNA-related molecules changes their electronic properties2023

    • Author(s)
      Hirato Misaki、Yokoya Akinari、Baba Yuji、Mori Seiji、Fujii Kentaro、Wada Shin-ichi、Izumi Yudai、Haga Yoshinori
    • Journal Title

      Physical Chemistry Chemical Physics

      Volume: 25 Issue: 21 Pages: 14836-14847

    • DOI

      10.1039/d3cp01597a

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Development of structural analysis in solution by combining soft X-ray absorption and Raman spectroscopies2023

    • Author(s)
      M. Saeki, T. Nakabayashi, K. Fujii, R. Nakanishi, H. Okazaki
    • Organizer
      UVSOR-III + MAX IV International Workshop
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 放射光軟X線分光による銅結合タンパク質の電子状態解析2023

    • Author(s)
      藤井健太郎, 泉雄大, 宮脇淳, 倉橋直也, 木内久雄, 原田慈久, 安達基泰
    • Organizer
      第5回量子生命科学会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Cu L-edge RIXS Spectra of Cu-Proteins2023

    • Author(s)
      Fujii K., Izumi Y., Miyawaki J., Kurahashi N., Kiuchi H., Harada Y., Adachi M.
    • Organizer
      RIXS/REXS Workshop 2023
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 電子状態的に見たDNA鎖切断2023

    • Author(s)
      藤井健太郎
    • Organizer
      Genome Damage Network研究会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Remarks] 水素エネルギー変換デバイスプロジェクト

    • URL

      https://www.qst.go.jp/site/adv-catl/

    • Related Report
      2023 Annual Research Report

URL: 

Published: 2023-04-18   Modified: 2024-12-25  

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