Research for infection immunity against global viral infections with a new bioinformatic approach

Research Project

Project/Area Number	23KK0176
Research Category	Fund for the Promotion of Joint International Research (International Collaborative Research)
Allocation Type	Multi-year Fund
Review Section	Medium-sized Section 58:Society medicine, nursing, and related fields
Research Institution	National Institute of Infectious Diseases
Principal Investigator	立川愛国立感染症研究所, エイズ研究センター, 室長 (10396880)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	山下和男 KOTAIバイオテクノロジーズ株式会社, 研究開発, 研究開発部長 (20749246) 木口悠也東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 特任助教 (40897500)
Project Period (FY)	2023-09-08 – 2027-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help	¥20,930,000 (Direct Cost: ¥16,100,000、Indirect Cost: ¥4,830,000) Fiscal Year 2026: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000) Fiscal Year 2025: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000) Fiscal Year 2024: ¥6,240,000 (Direct Cost: ¥4,800,000、Indirect Cost: ¥1,440,000) Fiscal Year 2023: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywords	ウイルス感染症 / 感染免疫 / デングウイルス / TCRレパトア / T細胞
Outline of Research at the Start	本研究では、世界に蔓延するウイルス感染症に対する免疫応答について、バイオインフォマティクスの手法を用いた新たな評価システムのプラットフォームを構築する。フランスパスツール研究所の海外共同研究者と連携し、感染症流行地域に展開する国際ネットワーク拠点において感染者検体を収集し、研究代表者の有するウイルス特異的なT細胞解析技術を共有し、TCR遺伝子(レパトア)情報を取得する。研究分担者の開発した独自技術にて解析を行い、ウイルス特異的なTCRレパトアデータベースを構築する。本研究で構築されるプラットフォームは、感染症流行国でのワクチン有効性評価等、公衆衛生上重要な感染症対策に活用することが期待される。
Outline of Annual Research Achievements	感染症は、公衆衛生上最も重要な克服すべき課題の一つである。感染症対策として各種ウイルスに対するワクチン開発が進められている。ワクチンは抗体応答とT細胞応答の誘導を目的としており、その有効性を明らかにするためには特異的な抗体とT細胞の適切な評価系が必要であるが、T細胞については十分に測定されておらず、ワクチンの有効性評価は、抗体に依存している場合が多い。本研究では、世界に蔓延するウイルス感染症に対する免疫応答について、バイオインフォマティクスの手法を用いた新たなT細胞応答評価システムのプラットフォームの構築を行う。本研究ではデングウイルス感染症を対象とし、フランスパスツール研究所の海外共同研究者と連携し、パスツール研究所が感染症流行地域に展開する国際ネットワーク拠点において、現地にて感染者検体を収集する。日本側研究グループの有するT細胞解析技術を共有し、TCRレパトア情報を取得、研究分担者の有する解析技術を用いてデングウイルス特異的TCRレパトアデータベースを構築する。本年度は、海外共同研究者と打ち合わせを行い、パスツールカンボジア拠点で研究を実施することを決定し、コホートデザイン・感染者検体の収集について決定した。デングウイルス特異的T細胞応答が高頻度に検出される感染後2ヶ月で検体を収集する必要があり、来年度のデングウイルス流行期での感染者を対象とすることを計画した。また、T細胞応答解析に関する技術提供を行い、カンボジアパスツール拠点において、現地スタッフによる実験技術の習得を開始し、その指導を行なった。
Current Status of Research Progress	Current Status of Research Progress 2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned. Reason 海外共同研究者（フランスパスツール研究所・パスツールカンボジア拠点）と複数回にわたり対面・webで打ち合わせを実施することで、今後の研究計画の詳細について決定することができた。来年度感染者検体の収集を行うが、それに向けて、必要な実験・解析技術を既に提供・指導を行なっており、現地で実施可能な状態となっている。来年度の流行シーズンでの検体収集に向けて、順調に準備を進められている。
Strategy for Future Research Activity	来年度、カンボジアでのデングウイルス流行期に、現地での検体収集を進め、デングウイルス特異的T細胞の解析を行う。デングウイルス特異的T細胞からTCR遺伝子を増幅し、TCRレパトア情報の収集を開始する。フランスパスツール研究所およびカンボジア拠点双方の研究者を訪問、密に連携を図り、効率よく研究を進める予定である。