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Study on the controlling mechanism of fibrin gel formation by the unordered region of fibrinogen and N-linked saccharide chain

Research Project

Project/Area Number 24550245
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Polymer/Textile materials
Research InstitutionGunma University

Principal Investigator

KUBOTA Kenji  群馬大学, 大学院理工学府, 教授 (40153332)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) NAMEKI Nobukazu  群馬大学, 大学院理工学府, 准教授 (80302959)
Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2012: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Keywordsゲル / 生体高分子 / フィブリノゲン / Bβ鎖N末端領域 / ラテラル凝集 / Fragment-D / 表面プラズモン共鳴 / Bβ鎖N末端領域 / N結合糖鎖 / フィブリン重合 / NDSK / Fragment-D / SPR / フィブリンゲル / N結合糖鎖
Outline of Final Research Achievements

The following schemes in the fibrin gel formation process were strongly suggested by the SPR measurements using recombinant (and mutated) fibrinogen fragment corresponding to the N-terminal region of fibrinogen Bβ chain: 66 amino acid residues in the N-terminal region of fibrinogen Bβpolypeptide chain (BβN) play an essential role in the fibrin gel formation through interacting with the distal D-regions of fibrinogen. The central factor in that interaction is the unordered region with high mobility around Bβ44R, especially Bβ44R contributes notably to the interaction. N-linked carbohydrate chain inhibitingly affects the interaction between BβN and D-region, thus suppresses the lateral aggregation of protofibrils.

Report

(4 results)
  • 2014 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2013 Research-status Report
  • 2012 Research-status Report
  • Research Products

    (34 results)

All 2014 2013 2012

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (29 results)

  • [Journal Article] Identification of residues required for stalled-ribosome rescue in the codon-independent release factor YaeJ.2014

    • Author(s)
      Kogure, H., Handa, H., Nagata, M., Kanai, N., Guntert, P., Kubota, K., Nameki, N.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 42 Issue: 5 Pages: 3152-3163

    • DOI

      10.1093/nar/gkt1280

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      K. Kubota, Y. Toyama, N. Nameki, K. Wakamatsu
    • Journal Title

      Key Engineering Materials

      Volume: 596 Pages: 213-218

    • DOI

      10.4028/www.scientific.net/kem.596.213

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      Ken-ichi Hatano, Naokazu Aoyagi, Takuya Miyakawa, Masaru Tanokura, Kenji Kubota
    • Journal Title

      Bioresour. Technol.

      Volume: 149 Pages: 541-545

    • DOI

      10.1016/j.biortech.2013.08.166

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    • Author(s)
      K. Hatano, I. Komatsu, N. Aoyagi, K. Takahashi, K. Kubota
    • Journal Title

      Environmental Science and Pollution Research

      Volume: 20 Issue: 6 Pages: 4009-4017

    • DOI

      10.1007/s11356-012-1364-4

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      K. Kubota, Y. Toyama, N. Nameki, K. Wakamatu
    • Journal Title

      Key Engineering Materials

      Volume: 534 Pages: 241-246

    • DOI

      10.4028/www.scientific.net/kem.534.241

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      桐生、桐生市市民文化会館
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      広島、広島工業大学
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      大宮、大宮ソニックシティビル
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      第37回日本バイオレオロジー学会年会
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      大宮、大宮ソニックシティビル
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      K. Kigawa, Y. Iizuka, K. Kubota, Y. Toyama, N. Nameki and K. Wakamatsu
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      5th International Conference on Advanced Micro-Device Engineering
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      バイオレオロジー学会
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      バイオレオロジー学会
    • Place of Presentation
      朱鷺メッセ (新潟市)
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Published: 2013-05-31   Modified: 2019-07-29  

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