Structural study of bacteriophage Mu

• Project/Area Number: 24570123
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Research Field: Structural biochemistry
• Research Institution: Gunma University
• Principal Investigator: TAKEDA Shigeki 群馬大学, 大学院理工学府, 教授 (80282854)
• Project Period (FY): 2012-04-01 – 2015-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2014)
• Budget Amount: ¥5,590,000 (Direct Cost: ¥4,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000); Fiscal Year 2014: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000); Fiscal Year 2013: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000); Fiscal Year 2012: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
• Keywords: バクテリオファージ / 形態形成 / 分子集合 / 自己組織化 / 自律的形態形成 / 分子相互作用

Outline of Final Research Achievements

We purified Mu phage tailfiber (gp49-gp50 complex) and neck subunit (gp36). We also crystallize them and determined their three dimensional structure. Tailfiber consisted of trimer of beta-strand and beta-helix. Neck gp36 was monomer and did not formed ring sturcture

Research Products

• [Journal Article] Identification of a morphogenetic intermediate of the bacteriophage Mu baseplate (2014)
  • Author(s): N. Tsukamoto, Y. Kanazawa, Y. Shimamori, K. Yoshida, S. Takeda,
  • Journal Title: Advances in Microbiology Volume: 4 Issue: 16 Pages: 1155-1163
  • DOI: 10.4236/aim.2014.416125
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Crystal structure of the C-terminal domain of Mu phage central spike and functions of bound calcium ion. (2013)
  • Author(s): Harada K
  • Journal Title: Biochim Biophys Acta., Volume: 1834 Issue: 1 Pages: 284-291
  • DOI: 10.1016/j.bbapap.2012.08.015
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Identification of physiologically active substances as novel ligands for MRGPRD (2012)
  • Author(s): M. Uno, S. Nishimura, K. Fukuchi, Y. Kaneta, Y. Oda, H. Komori, S. Takeda, T. Haga, T. Agatsuma, F. Nara
  • Journal Title: J. Biomedi. Biotech. Volume: 5 Pages: 816159-816159
  • DOI: 10.1155/2012/816159
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] MRGD, a MAS-related G-protein Coupled Receptor, Promotes Tumorigenisis and Is Highly Expressed in Lung Cancer (2012)
  • Author(s): S. Nishimura, M. Uno, Y. Kaneta, K. Fukuchi, H. Nishigohri, J. Hasegawa, H. Komori H, S. Takeda, K. Enomoto, F. Nara, T. Agatsuma
  • Journal Title: PLoS One Volume: 7 Issue: 6 Pages: e38618-e38618
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0038618
  • Peer Reviewed
• [Presentation] バクテリオファージMuのネックサブユニットgp36の結晶構造 (2014)
  • Author(s): 岩崎拓真, 山下栄樹, 中川敦史, 武田茂樹
  • Organizer: 日本分子生物学会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [Presentation] バクテリオファージMu尾繊維サブユニットとその特異的シャペロン複合体の精製、構造解析 (2014)
  • Author(s): 坂井 康平，山下 栄樹，武田 茂樹
  • Organizer: 日本分子生物学会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 2014-11-25
• [Presentation] バクテリオファージMuのネックサブユニットの単離と構造解析 (2014)
  • Author(s): 岩崎拓真, 武田茂樹, 山下栄樹
  • Organizer: 第5回ファージ研究会
  • Place of Presentation: 三重大学物資資源学部
  • Year and Date: 2014-09-04 – 2014-09-05
• [Presentation] Muファージ尾繊維タンパク質gpSとgpS’およびこれらの特異的シャペロンgpUとgpU’の精製 (2014)
  • Author(s): 坂井康平, 武田茂樹
  • Organizer: 第5回ファージ研究会
  • Place of Presentation: 三重大学物資資源学部
  • Year and Date: 2014-09-04 – 2014-09-05
• [Presentation] バクテリオファージMuネックサブユニットの構造解析 (2014)
  • Author(s): 岩崎拓真, 武田茂樹, 山下栄樹
  • Organizer: 第3回日本生物物理学会関東支部研究会
  • Place of Presentation: 明治大学中野キャンパス
  • Year and Date: 2014-04-06 – 2014-04-07
• [Presentation] バクテリオファージＭｕネックサブユニットの構造解析 (2014)
  • Author(s): 岩崎拓真、武田茂樹、山下栄樹
  • Organizer: 日本生物物理学会関東支部例会
  • Place of Presentation: 東京
• [Presentation] バクテリオファージMu基盤サブユニットの発現と精製 (2012)
  • Author(s): 塚本奈央、武田茂樹
  • Organizer: ファージ研究会
  • Place of Presentation: 群馬
• [Presentation] バクテリオファージMu基盤サブユニットgp43の発現と精製 (2012)
  • Author(s): 塚本奈央、武田茂樹
  • Organizer: 分子生物学会
  • Place of Presentation: 福岡
• [Remarks] 武田研究室の ホームページ
  • URL: http://stakeda.chem-bio.st.gunma-u.ac.jp/index.html