Functional analysis of splicing variants of multidrug-resitant ABC transporters expressed in gastrointestinal cancer

• Project/Area Number: 24591895
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Research Field: General surgery
• Research Institution: Tohoku University
• Principal Investigator: OHNUMA Shinobu 東北大学, 大学病院, 助教 (70451565)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): MIURA Koh 宮城県立がんセンター, がん薬物療法研究部, 特別研究員 (40282074)
• Project Period (FY): 2012-04-01 – 2015-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2014)
• Budget Amount: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000); Fiscal Year 2014: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2013: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000); Fiscal Year 2012: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
• Keywords: ABCトランスポーター / 大腸癌 / 多剤耐性 / スプライシング / Wntシグナル / βカテニン / 次世代シーケンサー / スプライシングバリアント

Outline of Final Research Achievements

Bioinformatics analysis showed that seventy-one out of total 502 splicing variants of ABC transporters, which are registered in Ensembl, were detected as candidates of potential colon-cancer-specific-splice-variants.
Experimental validations were performed for some of these candidates by RT-qPCR. ENST000005135112, one of ABCA12 splice variants, had reproducibility. This result strongly suggests that ENST000005135112 is a colon-cancer-specific-splice-variant.

Research Products

• [Journal Article] Gastrointestinal toxicities of 5-fluorouracil increase the proportion of regulatory T cells in intestinal tract: advantages of alternate-day S-1 administration. (2015)
  • Author(s): Kajiwara T, Miura K, Ohnuma S, Shimada M, Komura T, Toshima M, Kohyama A, Kudoh K, Haneda S, Musha H, Naitoh T, Shirasaka T, Unno M.
  • Journal Title: Int J Clin Oncol. Volume: In press
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Usefulness of alternate-day administration of S-1 and leucovorin in a xenograft mouse model of colorectal cancer: a shorter drug-free interval leads to more efficient antitumor effects. (2015)
  • Author(s): Komura T, Miura K, Shirasaka T, Ohnuma S, Shimada M, Kajiwara T, Fujishima F, Philchenkov A, Nakagawa K, Kudoh K, Haneda S, Toshima M, Kohyama A, Musha H, Naitoh T, Shibata C, Unno M.
  • Journal Title: Int J Clin Oncol. Volume: 20 (1) Issue: 1 Pages: 117-125
  • DOI: 10.1007/s10147-014-0699-x
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Two cases of advanced gastric cancer achieved pathological complete response by preoperative chemotherapy with S-1 plus weekly low-dose CDDP (2014)
  • Author(s): Kono E, Tanaka N, Kudo K, Musha H, Tsuchiya T, Miyachi T, Nagao M, Kajiwara T, Kimura S, Karasawa H, Aoki T, Abe T, Ohnuma S, Nakagawa K, Morikawa T, Yoshida H, Motoi F, Katayose Y, Naito T, Unno M.
  • Journal Title: Gan To Kagaku Ryoho Volume: 41 (12) Pages: 2279-2281
  • Open Access
• [Journal Article] A case report of complete pathological response of a locally advanced rectal cancer after long term chemotherapy (2014)
  • Author(s): Kobayashi M, Ohnuma S, Kato S, Karasawa H, Aoki T, Kudo K, Tanaka N, Wat
  • Journal Title: Gan To Kagaku Ryoho Volume: 41 (12) Pages: 1755-1757
  • Open Access
• [Journal Article] A case of pathological complete response to lt. Lateral lymph node metastasis from lower rectal cancer by s-1 combined neoadjuvant chemoradiotherapy (2014)
  • Author(s): Kimura S, Ohnuma S, Karasawa H, Aoki T, Kudoh K, Watanabe K, Tanaka N, Nagao M, Abe T, Musha H, Morikawa T, Motoi F, Katayose Y, Naitoh T, Unno M.
  • Journal Title: Gan To Kagaku Ryoho Volume: 41 (12) Pages: 1560-1562
  • Open Access
• [Journal Article] MDR1 synonymous polymorphisms alter transporter specificity and protein stability in a stable epithelial monolayer. (2014)
  • Author(s): Fung KL, Pan J, Ohnuma S, Lund PE, Pixley JN, Kimchi-Sarfaty C, Ambudkar SV, Gottesman MM.
  • Journal Title: Cancer Res. Volume: 74(2) Issue: 2 Pages: 598-608
  • DOI: 10.1158/0008-5472.can-13-2064
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Tandutinib (MLN518/CT53518) targeted to stem-like cells by inhibiting the function of ATP-binding cassette subfamily G member 2. (2013)
  • Author(s): Zhao XQ, Dai CL, Ohnuma S, Liang YJ, Deng W, Chen JJ, Zeng MS, Ambudkar SV, Chen ZS, Fu LW.
  • Journal Title: Eur J Pharm Sci. Volume: 49(3) Issue: 3 Pages: 441-450
  • DOI: 10.1016/j.ejps.2013.04.015
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Therapeutic strategy for neuroendocrine tumor of the rectum (2013)
  • Author(s): Ohnuma S, Naitoh T, Haneda S, Kudoh K, Kohyama A, Nagao M, Tanaka N, Sasaki H, Aoki T, Abe T, Musha H, Morikawa T, Yoshida H, Motoi F, Katayose Y, Shibata C, Unno M.
  • Journal Title: Gan To Kagaku Ryoho. Volume: 40(12) Pages: 2077-2079
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Adenocarcinoma associated with perianal fistulas in Crohn's disease. (2013)
  • Author(s): Ogawa H, Haneda S, Shibata C, Miura K, Nagao M, Ohnuma S, Kohyama A, Unno M.
  • Journal Title: Anticancer Res. Volume: 33(2) Pages: 685-689
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Splice isoforms as therapeutic targets for colorectal cancer. (2012)
  • Author(s): Miura K, Fujibuchi W, Unno M.
  • Journal Title: Carcinogenesis. Volume: 33(12) Issue: 12 Pages: 2311-2319
  • DOI: 10.1093/carcin/bgs347
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] IL-23 directly enhances the proliferative and invasive activities of colorectal carcinoma. (2012)
  • Author(s): Suzuki H, Ogawa H, Miura K, Haneda S, Watanabe K, Ohnuma S, Sasaki H, Sase T, Kimura S, Kajiwara T, Komura T, Toshima M, Matsuda Y, Shibata C, Sasaki I.
  • Journal Title: Oncol Lett. Volume: 4(2) Pages: 199-204
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Runt-related transcription factor 2 in human colon carcinoma: A potent prognostic factor associated with estrogen receptor. (2012)
  • Author(s): Sase T
  • Journal Title: Int. J. Cancer Volume: 131 Issue: 10 Pages: 2284-2293
  • DOI: 10.1002/ijc.27525
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Young-onset peri-anorectal leiomyomatosis: report of a case. (2012)
  • Author(s): Toshima M, Miura K, Ishida K, Mizoi T, Naitoh T, Ogawa H, Ohnuma S, Sasaki H, Watanabe K, Haneda S, Sase T, Kajiwara T, Matsuda Y, Shibata C, Sasaki I.
  • Journal Title: Surg Today Volume: 43(3) Issue: 3 Pages: 329-334
  • DOI: 10.1007/s00595-012-0201-1
  • NAID: 10031168013
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A unique variant of afferent limb syndrome after ileal pouch-anal anastomosis: a case series and review of the literature (2012)
  • Author(s): Ogawa H, Haneda S, Watanabe K, Suzuki H, Miura K, Ohnuma S, Sasaki H, Shibata C, Unno M
  • Journal Title: J Gastrointest Surg Volume: 16(8) Issue: 8 Pages: 1581-4
  • DOI: 10.1007/s11605-012-1872-z
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 大腸癌に発現する抗癌剤耐性ABCトランスポーターのスプライスバリアント解析 (2015)
  • Author(s): 小林 実、大沼 忍、 唐沢秀明、他
  • Organizer: 第101回日本消化器病学会
  • Place of Presentation: 仙台
  • Year and Date: 2015-04-23 – 2015-04-25
• [Presentation] 局所再発、再発直腸癌に対する外科治療 (2015)
  • Author(s): 大沼 忍
  • Organizer: 第13回山形骨盤外科研究会
  • Place of Presentation: 山形
  • Year and Date: 2015-01-24
  • Invited
• [Presentation] Transcriptome analysis of human ABC-transporters in colorectal cancer cell lines and surgically resected cancer tissues (2014)
  • Author(s): Minoru Kobayashi, Shinobu Ohnuma, Ryo Funayama, Michiaki Unno, Keiko Nakayama
  • Organizer: 2nd NIH-Japan-JSPS Symposium
  • Place of Presentation: Bethesda, MD, USA
  • Year and Date: 2014-10-23 – 2014-10-24
• [Presentation] 臨床医から見たバイオインフォマティクス「大腸癌特異的なABCトランスポーターのスプライスバリアント解析」 (2014)
  • Author(s): 小林 実
  • Organizer: 日本バイオインフォマティクス学会
  • Place of Presentation: 仙台
  • Year and Date: 2014-10-02 – 2014-10-04
• [Presentation] 進化する大腸がん治療 (2014)
  • Author(s): 大沼 忍
  • Organizer: 第6回元気健康フェアinとうほく
  • Place of Presentation: 仙台
  • Year and Date: 2014-04-06
  • Invited
• [Presentation] 結腸癌に対する腹腔鏡下結腸切除術における腹部手術既往の影響 (2013)
  • Author(s): 大沼 忍, 内藤 剛, 阿部 友哉, 佐々木 宏之, 神山 篤史, 羽根田 祥, 工藤 克昌, 長尾 宗紀, 青木 豪, 田中 直樹, 武者 宏昭, 森川 孝則, 片寄 友, 柴田 近, 海野 倫明
  • Organizer: 第26回日本内視鏡外科学会総会
  • Place of Presentation: 福岡
• [Presentation] 大腸癌化学療法 東北大学病院での取り組み (2013)
  • Author(s): 大沼 忍
  • Organizer: 第62回日本農村医学会学術総会
  • Place of Presentation: 福島
  • Invited
• [Presentation] 直腸GISTの治療戦略 (2013)
  • Author(s): 大沼 忍, 内藤 剛, 佐々木 宏之, 長尾 宗紀, 羽根田 祥, 工藤 克昌, 神山 篤史, 柴田 近, 海野 倫明
  • Organizer: 第68日本大腸肛門病学会学術集会
  • Place of Presentation: 東京
• [Presentation] Stage IV大腸癌手術例における長期生存例の特徴 (2013)
  • Author(s): 大沼 忍, 内藤 剛, 阿部 友哉, 長尾 宗紀, 羽根田 祥, 佐々木 宏之, 神山 篤史, 片寄 友, 柴田 近, 海野 倫明
  • Organizer: 第51日本癌治療学会学術集会
  • Place of Presentation: 京都
• [Presentation] Analysis of the single nucleotide polymorphisms of the DPYD gene that affect adverse events in 5-FU treated patients (2013)
  • Author(s): Masahide Toshima, Shinobu Ohnuma, Koh Miura, Michihiro Tanaka, Hiroaki Mush, Sho Haneda, Katsuyoshi Kudo, Atsushi Kohyama, Munenori Nagao, Takeshi Naitoh, Yu Katayose, Chikashi Shibata, Michiaki Unno
  • Organizer: 第72回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] 直腸神経内分泌腫瘍に対する治療方針 (2013)
  • Author(s): 大沼 忍, 内藤 剛, 阿部 友哉, 長尾 宗紀, 羽根田 祥, 佐々木 宏之, 神山 篤史, 森川 孝則, 笠島 敦子, 片寄 友, 柴田 近, 海野 倫明
  • Organizer: 第1回神経内分泌腫瘍研究会学術集会
  • Place of Presentation: 京都
• [Presentation] ステージIV大腸癌の細分類および治療戦略 StageIV大腸癌の長期生存例の解析に基づく治療戦略 (2013)
  • Author(s): 大沼 忍, 三浦 康, 内藤 剛, 佐々木 宏之, 羽根田 祥, 渡辺 和宏, 松田 泰史, 柴田 近, 佐々木 巖, 海野 倫明
  • Organizer: 第67回日本消化器外科学会総会
  • Place of Presentation: 宮崎
• [Presentation] 直腸神経内分泌腫瘍に対する手術症例の検討 (2013)
  • Author(s): 大沼 忍, 内藤 剛, 羽根田 祥, 工藤 克昌, 神山 篤史, 長尾 宗紀, 田中 直樹, 佐々木 宏之, 森川 孝則, 吉田 寛, 鹿郷 昌之, 元井 冬彦, 小川 仁, 片寄 友, 三浦 康, 柴田 近, 海野 倫明
  • Organizer: 第35回日本癌局所療法研究会
  • Place of Presentation: 神戸
• [Presentation] 直腸カルチノイド手術症例の検討 (2013)
  • Author(s): 大沼 忍, 三浦 康, 内藤 剛, 羽根田 祥, 工藤 克昌, 長尾 宗紀, 田中 直樹, 佐々木 宏之, 鹿郷 昌之, 森川 孝則, 鈴木 秀幸, 梶原 大輝, 戸嶋 政秀, 小村 俊博, 松田 泰史, 染谷 崇徳, 吉田 寛, 元井 冬彦, 片寄 友, 柴田 近, 海野 倫明
  • Organizer: 第113回日本外科学会定期学術総会
  • Place of Presentation: 福岡
• [Presentation] Stemofoline is a potent natural product modulator of the multidrug resistance-linked P-glycoprotein (ABCB1) (2013)
  • Author(s): Shinobu Ohnuma, Wisinee Chanmahasathien, Koh Miura, Michiaki Unno, Suresh V. Ambudkar, Pornngarm Limtrakul
  • Organizer: American Association for Cancer Research
  • Place of Presentation: Washington D.C., U.S.A.
• [Presentation] 腹腔鏡補助下直腸切除術42症例の検討 (2012)
  • Author(s): 大沼忍, 内藤 剛, 鹿郷 昌之, 森川 孝則, 田中 直樹, 佐々木 宏之, 長尾 宗紀, 羽根田 祥, 工藤 克昌, 吉田 寛, 元井 冬彦, 三浦 康, 片寄 友, 柴田 近, 海野 倫明
  • Organizer: 第25回日本内視鏡外科学会
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] 70歳以上高齢者大腸癌に対する経口フッ化ピリミジン製剤による補助化学療法 (2012)
  • Author(s): 大沼 忍, 三浦 康, 内藤 剛, 長尾 宗紀, 羽根田 祥, 佐々木 宏之, 工藤 克昌, 鈴木 秀幸, 戸嶋 政秀, 梶原 大輝, 柴田 近, 海野 倫明
  • Organizer: 第67回日本大腸肛門病学会
  • Place of Presentation: 福岡
• [Presentation] 直腸癌局所再発に対する外科治療の功罪 (2012)
  • Author(s): 大沼忍, 三浦康, 内藤剛, 小川仁, 羽根田祥, 渡辺和宏, 佐々木宏之, 佐瀬友彦, 柴田近, 鹿郷昌之, 森川孝則, 田中直樹, 工藤克昌, 鈴木秀幸, 梶原大輝, 戸嶋政秀, 松田泰史, 小村俊博, 海野倫明, 佐々木巖
  • Organizer: 第112回日本外科学会
  • Place of Presentation: 千葉
• [Presentation] Stage IV大腸癌の長期生存例の解析に基づく治療戦略 (2012)
  • Author(s): 大沼忍 三浦康 内藤剛 羽根田祥 渡辺和宏 佐々木宏之 松田泰史 柴田近 佐々木巖 海野倫明
  • Organizer: 第67回日本消化器外科学会
  • Place of Presentation: 富山
• [Presentation] Stemofoline is a potent natural product modulator of the multidrug resistance-linked P-glycoprotein (ABCB1) (2012)
  • Author(s): Ohnuma S, Chanmahasathien W, Miura K, Sasaki H, Kajiwara T, Komura T, Toshima M, Matsuda Y, Katayose Y, Shibata C, Unno M、Ambudkar SV, Limtrakul P.
  • Organizer: 第71回日本癌学会
  • Place of Presentation: 札幌