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低分子RNAネットワークのシステム的理解と新たな癌制御アプローチへの応用

Research Project

Project/Area Number 24689018
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (A)

Allocation TypePartial Multi-year Fund
Research Field Pathological medical chemistry
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

鈴木 洋  東京大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (00587793)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2014-03-31
Project Status Discontinued (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥26,520,000 (Direct Cost: ¥20,400,000、Indirect Cost: ¥6,120,000)
Fiscal Year 2014: ¥8,580,000 (Direct Cost: ¥6,600,000、Indirect Cost: ¥1,980,000)
Fiscal Year 2013: ¥8,450,000 (Direct Cost: ¥6,500,000、Indirect Cost: ¥1,950,000)
Fiscal Year 2012: ¥9,490,000 (Direct Cost: ¥7,300,000、Indirect Cost: ¥2,190,000)
KeywordsmicroRNA / 低分子RNA / がん / がん微小環境 / ネットワーク / 病理学 / 遺伝子 / システム生物学 / 癌 / シグナル伝達
Research Abstract

本研究では、様々な病態における低分子RNAの発現異常の分子基盤となる低分子RNA生合成経路の新規調節機構、および悪性腫瘍との関係を明らかにすることを目的とする。また、低分子RNAの作動機構をネットワークレベルでシステム的に理解することを目的とする。平成24年度では、まず、miRNAによる標的mRNAの抑制効果を複数の内在性miRNAの発現量が変動する状況に外挿することが可能であるかを検討した。このために、GSEA-FAME analysis(GFA)という新規解析手法を開発し、癌のトランスクリプトームにおいてmiRNAがmRNA発現に与える負の影響が広範囲に観察されること、この原理を応用して、より頑健な新規バイオマーカーや新規治療標的をゲノムワイド発現解析から抽出できる可能性を明らかにした(Nucleic Acid Res, 41, e62)。また、これまでにMCPIP1と呼ばれるribonucleaseがmiRNAの生合成を抑制することを見出しているが、平成24年度では、MCPIP1によるmiRNA前駆体の分解を抑制するRNA結合タンパクLaとMCPIP1の関係について、乳癌の遺伝子発現データを解析し、DicerおよびLaとMCPIP1が拮抗関係にあることを見出した(J Biol Chem, 288, 723-736)。平成25年度では、GFA解析をT細胞リンパ腫の網羅的遺伝子発現解析データに拡張し、各リンパ腫サブタイプが特徴的なmiRNA活性パターンを示すことを明らかにするとともに、NPM-ALK陽性の悪性リンパ腫(未分化大細胞型リンパ腫)で発現異常が認められる複数のmiRNAの同定に成功し、mRNA発現データの解析からmiRNA―mRNAネットワークを類推できる可能性を新たに見出した(Leukemia, 27, 2107-2111)。

Current Status of Research Progress
Reason

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2013 Annual Research Report
  • 2012 Annual Research Report
  • Research Products

    (50 results)

All 2014 2013 2012 Other

All Journal Article (17 results) (of which Peer Reviewed: 9 results,  Open Access: 2 results) Presentation (29 results) (of which Invited: 8 results) Book (4 results)

  • [Journal Article] EVI1 oncogene promotes KRAS pathway through suppression of microRNA-96 in pancreatic carcinogenesis.2014

    • Author(s)
      Tanaka M, Suzuki HI, Shibahara J, Kunita A, Isagawa T, Yoshimi A, Kurokawa M, Miyazono K, Aburatani H, Ishikawa S, Fukayama M.
    • Journal Title

      Oncogene

      Volume: 33(19) Issue: 19 Pages: 2454-63

    • DOI

      10.1038/onc.2013.204

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Computational dissection of distinct microRNA activity signatures associated with peripheral T cell lymphoma subtypes2013

    • Author(s)
      Suzuki HI
    • Journal Title

      Leukemia

      Volume: 27 Issue: 10 Pages: 2107-2111

    • DOI

      10.1038/leu.2013.121

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Bone morphogenetic protein-9 inhibits lymphatic vessel formation via activin receptor-like kinase 1 during development and cancer progression2013

    • Author(s)
      Yoshimatsu Y
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.

      Volume: 10 Issue: 47 Pages: 18940-18945

    • DOI

      10.1073/pnas.1310479110

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Circular RNA―RNAの新しい形とその機能2013

    • Author(s)
      鈴木洋
    • Journal Title

      実験医学

      Volume: 31(9) Pages: 1385-1386

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      2013 Annual Research Report
  • [Journal Article] RNA言語を編む : miRNA-mRNAネットワーク同定へのアプローチ2013

    • Author(s)
      鈴木洋,宮園浩平
    • Journal Title

      細胞工学

      Volume: 32(8) Pages: 886-892

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      2013 Annual Research Report
  • [Journal Article] 遺伝子発現解析を用いたリンパ系腫瘍の分類2013

    • Author(s)
      鈴木洋,宮園浩平
    • Journal Title

      血液内科

      Volume: 67(6) Pages: 750-754

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      2013 Annual Research Report
  • [Journal Article] p53 actions on microRNA expression and maturation pathway2013

    • Author(s)
      Suzuki HI
    • Journal Title

      Methods Mol Biol

      Volume: 962 Pages: 165-181

    • DOI

      10.1007/978-1-62703-236-0_14

    • ISBN
      9781627032353, 9781627032360
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      2012 Annual Research Report
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  • [Journal Article] Widespread inference of weighted microRNA-mediated gene regulation in cancer transcriptome analysis2013

    • Author(s)
      Suzuki HI
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res

      Volume: 41 Issue: 5 Pages: e62-e62

    • DOI

      10.1093/nar/gks1439

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  • [Journal Article] Prostate cancer cells and bone stromal cells mutually interact with each other through bone morphogenetic protein-mediated signals2012

    • Author(s)
      Nishimori H
    • Journal Title

      J Biol Chem

      Volume: 287 Issue: 24 Pages: 20037-20046

    • DOI

      10.1074/jbc.m112.353094

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      2012 Annual Research Report
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  • [Journal Article] Sjogren syndrome antigen B (SSB)/La promotes global microRNA expression by binding microRNA precursors through stem-loop recognition.2012

    • Author(s)
      C Liang, et al.
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 288(1) Pages: 723-736

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      2012 Annual Research Report
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  • [Journal Article] Control of MicroRNA Maturation by p53 Tumor Suppressor and MCPIP1 Ribonuclease.2012

    • Author(s)
      HI Suzuki, et al.
    • Journal Title

      The Enzymes

      Volume: 32 Pages: 163-183

    • DOI

      10.1016/b978-0-12-404741-9.00008-8

    • ISBN
      9780124047419
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      2012 Annual Research Report
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  • [Journal Article] Characterization of human lung cancer-associated fibroblasts in three dimensional in vitro co-culture model2012

    • Author(s)
      Masafumi Horie, Akira Saito, Mitsuhiro Ohshima, Yasuyuki Morishita, Jun Nakajima, Tadashi Kohyama, Takahide Nagase
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun

      Volume: 423 Issue: 2 Pages: 158-163

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0056587

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      2012 Annual Research Report
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  • [Journal Article] がんにおけるmiRNA生合成機構の異常と治療標的としての可能性2012

    • Author(s)
      鈴木洋, 宮園浩平
    • Journal Title

      遺伝子医学MOOK

      Volume: 23 Pages: 214-218

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      2012 Annual Research Report
  • [Journal Article] microRNAプロセシングとがん制御シグナル経路のクロストーク2012

    • Author(s)
      鈴木洋, 宮園浩平
    • Journal Title

      細胞

      Volume: 44(10) Pages: 448-451

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      2012 Annual Research Report
  • [Journal Article] がん抑制遺伝子p53によるマイクロRNAプロセシング制御の解明2012

    • Author(s)
      鈴木洋
    • Journal Title

      最新医学

      Volume: 67(9) Pages: 2050-2055

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      2012 Annual Research Report
  • [Journal Article] 疾患モジュレーターとしての低分子RNA生合成機構2012

    • Author(s)
      鈴木洋, 宮園浩平
    • Journal Title

      細胞

      Volume: 44(14) Pages: 589-592

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      2012 Annual Research Report
  • [Journal Article] 慢性リンパ性白血病におけるmicroRNAの機能異常2012

    • Author(s)
      鈴木洋, 宮園浩平
    • Journal Title

      血液内科

      Volume: 65(6) Pages: 846-852

    • NAID

      40019555265

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      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Widespread inference of weighted microRNA-mediated gene regulation in cancer transcriptome analysis2013

    • Author(s)
      HI Suzuki, et al.
    • Organizer
      Keystone symposia "RNA Silencing"
    • Place of Presentation
      Whietler Conference Centre(カナダ)
    • Year and Date
      2013-03-22
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      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Widespread inference of weighted microRNA-mediated gene regulation in cancer transcriptome analysis2013

    • Author(s)
      HI Suzuki, et al.
    • Organizer
      9th Joint Conference of the American Association for Cancer Research and the Japanese Cancer Association
    • Place of Presentation
      ハイアツトリージェンシー(アメリカ合衆国)
    • Year and Date
      2013-02-24
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      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] BMP-9/ALK-1 signals inhibit proliferation of lymphatic endothelial cells and reprogram them to blood vascular endothelial cells through down-regulation of Proxl expression2013

    • Author(s)
      Y Yoshimatsu, et al.
    • Organizer
      9th Joint Conference of the American Association for Cancer Research and the Japanese Cancer Association
    • Place of Presentation
      ハイアツトリージェンシー(アメリカ合衆国)
    • Year and Date
      2013-02-24
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      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 低分子RNAの生合成機構の多様性と病態形成での役割に関する研究2013

    • Author(s)
      HI Suzuki.
    • Organizer
      新学術領域「RNA制御学」班会議
    • Place of Presentation
      レオパレス仙台(宮城県 仙台市)
    • Year and Date
      2013-01-07
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      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] BMP-9 inhibits proliferation of lymphatic endothelial cells and reprograms them to blood vascular endothelial cells through downregulation of Proxl expression2012

    • Author(s)
      Y Yoshimatsu, et al.
    • Organizer
      第20回日本血管生物医学会学術集会
    • Place of Presentation
      あわぎんホール(徳島県 徳島市)
    • Year and Date
      2012-12-06
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  • [Presentation] Widespread inference of weighted microRNA-mediated gene regulation in cancertranscriptome analysis2012

    • Author(s)
      HI Suzuki, et al.
    • Organizer
      The 2nd International Symposium by JSPS Core-to-CoreProgram ″Cooperative International Framework in TGF-β Family Signaling″
    • Place of Presentation
      昭和薬科大学(東京都 町田市)
    • Year and Date
      2012-10-29
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      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] BMP-9 inhibits proliferation of lymphatic endothelial cells and reprograras them to blood vascular endothelial cells through downregulation of Proxl expression2012

    • Author(s)
      Y Yoshimatsu, et al.
    • Organizer
      The 2nd International Symposium by JSPS Core-to-Core Program ″Cooperative International Framework in TGF-β Family Signaling″
    • Place of Presentation
      昭和薬科大学(東京都 町田市)
    • Year and Date
      2012-10-29
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      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Complexity of microRNA biogenesis and Inference of small RNA network through transcriptome analysis2012

    • Author(s)
      HI Suzuki, K Miyazono.
    • Organizer
      第71回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      札幌市教育文化会館(北海道 札幌市)
    • Year and Date
      2012-09-20
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      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] small RNA研究の最前線~microRNAの生合成と機能解析~2012

    • Author(s)
      HI Suzuki.
    • Organizer
      第5回Symphony
    • Place of Presentation
      ホテルメトロポリタンェドモント飯田橋(東京都 千代田区)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-09-02
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  • [Presentation] Specialization of microRNA biogenesis pathways and their alteration in human cancer2012

    • Author(s)
      HI Suzuki.
    • Organizer
      第22回広島がんセミナー・第4回JARIジョイント国際シンポジウム
    • Place of Presentation
      グランドプリンスホテル広島(招待講演)
    • Year and Date
      2012-08-30
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  • [Presentation] TGF-βによる内皮間葉移行におけるRhoシグナルとMRTF転写因子の役割2012

    • Author(s)
      H Mihira, HI Suzuki, et al.
    • Organizer
      第48回日本小児循環器学会
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館(京都府 京都市)
    • Year and Date
      2012-07-05
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      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Negative regulation of miRNA biogenesis by MCPIP1 ribonuclease2012

    • Author(s)
      HI Suzuki.
    • Organizer
      RNAi, MicroRNAs, Single Cell Biology & Stem Cells -2012 Meeting
    • Place of Presentation
      Hilton Garden Inn(アメリカ合衆国)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-05-01
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      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 拡大する小さなRNAの世界~miRNAめ生合成と癌における役割~2012

    • Author(s)
      HI Suzuki, K Miyazono.
    • Organizer
      日本分子生物学会第12回春季シンポジウム
    • Place of Presentation
      石和温泉慶山(山梨県 笛吹市)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-04-25
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      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] MS-1血管内皮細胞におけるTGF-betaによる間葉細胞移行の分子機序2012

    • Author(s)
      H Mihira, HI Suzuki, et al.
    • Organizer
      第115回日本小児科学会学術集会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡県 福岡市)
    • Year and Date
      2012-04-22
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      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 診断・治療への応用を目指した microRNAネットワークの理解

    • Author(s)
      HI Suzuki, K Miyazono.
    • Organizer
      ゲノム創薬フォーラム第32回談話会:マイクロRNAの新展開と創薬への利用
    • Place of Presentation
      東京大学医科学研究所(東京都 港区)
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      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] microRNA研究の新展開

    • Author(s)
      HI Suzuki, K Miyazono.
    • Organizer
      第1回AAA
    • Place of Presentation
      ロイヤルパークホテル(東京都 中央区)
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      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] RNA言語を編む

    • Author(s)
      HI Suzuki, K Miyazono.
    • Organizer
      東京医科大学 がん医科学分野 大学院領域特別講義
    • Place of Presentation
      東京医科大学(東京都 新宿区)
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      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Beyond fine tuners: microRNAの生合成とネットワーク制御 の分子基盤

    • Author(s)
      HI Suzuki.
    • Organizer
      平成25年度 文部科学省 新学術領域研究 がん研究分野の特性等を踏まえた支援活動 公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      一橋大学一橋講堂(東京都 千代田区)
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      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] TGF-βによる内皮間葉系細胞移行におけるRhoシグナルとMRTF転写因子の役割

    • Author(s)
      H Mihira, HI Suzuki, et al.
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県 横浜市)
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  • [Presentation] リンパ管発生および腫瘍リンパ管新生におけるBMP-9/ALK-1シグナルの役割

    • Author(s)
      Y Yoshimatsu, et al.
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県 横浜市)
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  • [Presentation] FGF/MEK signals maintain the identity of tumor endothelial cells through negative regulation of TGF-b-induced endothelial-to-mesenchymal transition (EndMT)

    • Author(s)
      Y Akatsu, A Katsura, et al.
    • Organizer
      第21回日本血管生物医学会学術集会
    • Place of Presentation
      千里阪急ホテル(大阪府 豊中市)
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  • [Presentation] BMP-9/ALK-1 signals negatively regulate the lymphatic vessel formation in development and cancer by downregulating Prox 1

    • Author(s)
      Y Yoshimatsu, et al.
    • Organizer
      第21回日本血管生物医学会学術集会
    • Place of Presentation
      千里阪急ホテル(大阪府 豊中市)
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  • [Presentation] Decoding RNA language for the future nucleic acid medicine

    • Author(s)
      HI Suzuki, K Miyazono.
    • Organizer
      第72回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県 横浜市)
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    • Invited
  • [Presentation] マイクロRNA生合成機構および マイクロRNAネットワークに関する研究

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      HI Suzuki.
    • Organizer
      第72回日本癌学会学術総会
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      パシフィコ横浜(神奈川県 横浜市)
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  • [Presentation] Computational dissection of microRNA-mRNA network by GSEA-FAME analysis

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      HI Suzuki, H Matsuyama, et al.
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      The 3rd International Symposium by JSPS Core-to-Core Program “Cooperative International Framework in TGF-β Family Signaling”
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      大和屋本店(愛媛県 松山市)
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  • [Presentation] BMP-9 negatively regulates lymphatic vessel formation

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      Y Yoshimatsu, et al.
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      The 3rd International Symposium by JSPS Core-to-Core Program “Cooperative International Framework in TGF-β Family Signaling”
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      大和屋本店(愛媛県 松山市)
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  • [Presentation] Understanding RNA language for the future nucleic acid medicine

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      HI Suzuki, K Miyazono.
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      Small RNAs to Stem Cells & Epigenetic Reprogramming Asia-2013 Meeting
    • Place of Presentation
      山上会館(東京都 文京区)
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  • [Presentation] microRNAバイオロジーの新展開

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      HI Suzuki, K Miyazono.
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      鳥取大学 特別講義
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      鳥取大学(鳥取県 鳥取市)
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  • [Presentation] microRNA バイオロジーと 次世代核酸医薬の交差点

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      HI Suzuki, K Miyazono.
    • Organizer
      日本がん分子標的治療学会第9回TRワークショップ
    • Place of Presentation
      都市センターホテル(東京都 千代田区)
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  • [Book] 原理からよくわかるリアルタイムPCR完全実験ガイド 10章 miRNA 生合成経路をみる MCPIP1 がmiRNA 生合成に与える影響を例に2013

    • Author(s)
      鈴木洋,宮園浩平
    • Publisher
      羊土社
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    • Author(s)
      鈴木洋
    • Publisher
      化学同人
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  • [Book] がん増殖と悪性化の分子機構(宮澤恵二・伊藤進 編) 11章 がんとオートファジー2012

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      鈴木洋
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      化学同人
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  • [Book] デヴィータがんの分子生物学 30章 リンパ腫2012

    • Author(s)
      鈴木洋
    • Publisher
      メディカル・サイエンス・インターナショナル
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      2012 Annual Research Report

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Published: 2012-04-24   Modified: 2019-07-29  

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