Feedback regulation of epigenome by metabolism upon adaptation to nutrition environment

• Project/Area Number: 24710225
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Research Field: System genome science
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: MATSUMURA YOSHIHIRO 東京大学, 先端科学技術研究センター, 助教 (20375257)
• Project Period (FY): 2012-04-01 – 2014-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2013)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2013: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000); Fiscal Year 2012: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
• Keywords: 代謝ネットワーク / エピゲノム / 生活習慣病 / 代謝 / ヒストンメチル化

Research Abstract

Purpose of this study is to identify epigenetic regulation of cellular metabolism upon adaptation to nutrition environment and feedback regulation of epigenome by metabolism. Next generation sequence analysis revealed histone methyltransferase SETDB1 regulates metabolic switch during adipogenesis, and histone demethylases JMJD1A regulates energy expenditure in brown adipose tissue. Furthermore, metabolome analysis suggested the possibility of epigenome regulation by TCA cycle metabolite a-ketoglutarate during adipogenesis.

Research Products

• [Journal Article] Endoplasmic reticulum protein quality control is determined by cooperative interactions between Hsp/c70 protein and the CHIP E3 ligase (2013)
  • Author(s): Yoshihiro Matsumura, Juro Sakai, William R. Skach.
  • Journal Title: J. Biol. Chem. Volume: 288 Pages: 3109-31079
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Endoplasmic reticulum protein quality control is determined by cooperative interactions between Hsp/c70 protein and the CHIP E3 ligase (2013)
  • Author(s): Matsumura Y, Sakai J, Skach WR
  • Journal Title: J Biol Chem Volume: 288 Issue: 43 Pages: 31069-31079
  • DOI: 10.1074/jbc.m113.479345
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 脂肪細胞分化におけるヒストンユビキチン修飾とFbxl10の役割 (2013)
  • Author(s): 岩崎聡、松村欣宏、川村猛、田中十志也、鶴谷悠也、馬郡健太、阿部陽平、山崎あゆむ、中村加奈子、吉田文乃、稲垣毅、酒井寿郎
  • Organizer: 第1回生活習慣病の分子細胞病態学研究会
  • Year and Date: 2013-03-23
• [Presentation] Histone H3K9 methyltransferase SETDB1 regulates metabolic switch of preadipocytes to adipocytes through repression of C/ebpα (2013)
  • Author(s): Yoshihiro Matsumura
  • Organizer: Cold Spring Harbor Asia Conference, Nuclear Receptors and Diseases
• [Presentation] SETDB1結合サイトのゲノムワイド解析から明らかになったRNAポリメラーゼIIの新たな停止機構 (2013)
  • Author(s): 松村欣宏、吉田文乃、仲木竜、若林賢一、稲垣毅、深見希代子、油谷浩幸、酒井寿郎
  • Organizer: 第36回日本分子生物学会年会
• [Presentation] 脂肪細胞分化および骨細胞分化におけるSETDYの機能解明 (2013)
  • Author(s): 山崎あゆむ、馬郡健太、松村欣宏、稲垣毅、野出孝一、酒井寿郎
  • Organizer: 第36回日本分子生物学会年会
• [Presentation] ヒストン脱メチル化酵素JMJD1Aのリン酸化修飾とエネルギー消費との関連 (2013)
  • Author(s): 阿部陽平、Royhan Rozqie、川村猛、谷村恭子、松村欣宏、稲垣毅、白石正、酒井寿郎
  • Organizer: 第36回日本分子生物学会年会
• [Presentation] Histone H3K9 methyltransferase SETDB1 regulates metabolic switch of preadipocytes to adipocytes through repression of C/ebpα (2013)
  • Author(s): Yoshihiro Matsumura
  • Organizer: Cold Spring Harbor Asia Conferences, Nuclear Receptors and Diseases
  • Place of Presentation: Suzhou Dushu Lake Conference Center, China
• [Presentation] SETDB1結合サイトのゲノムワイド解析から明らかになったRNAポリメラーゼIIの新たな停止機構 (2013)
  • Author(s): 松村欣宏、吉田文乃、仲木竜、若林賢一、稲垣毅、深見希代子、油谷浩幸、酒井寿郎
  • Organizer: 第36回 日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸国際会議場
• [Presentation] 脂肪細胞分化および骨細胞分化におけるSETDYの機能解明 (2013)
  • Author(s): 山崎あゆむ、馬郡健太、松村欣宏、稲垣毅、野出孝一、酒井寿郎
  • Organizer: 第36回 日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸国際会議場
• [Presentation] ヒストンメチル化酵素JMJD1Aのリン酸化修飾とエネルギー消費との関連 (2013)
  • Author(s): 阿部陽平、Royhan Rozqie、川村猛、谷村恭子、松村欣宏、稲垣毅、白石正、酒井寿郎
  • Organizer: 第36回 日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸国際会議場
• [Presentation] 脂肪細胞分化におけるヒストンユビキチン修飾とFbxl10の役割 (2013)
  • Author(s): 岩崎 聡、松村 欣宏、川村 猛、田中 十志也、鶴谷 悠也、馬郡 健太、阿部 陽平、山崎 あゆむ、中村 加奈子、吉田 文乃、稲垣 毅、酒井 寿郎
  • Organizer: 第1回 生活習慣病の分子細胞病態学研究会
  • Place of Presentation: ロイヤルパークホテル（東京都）
• [Presentation] 脂肪細胞分化におけるヒストンメチル化酵素Setdb1の役割 (2012)
  • Author(s): 松村欣宏
  • Organizer: 第9回FAT DM研究会
  • Year and Date: 2012-11-01
• [Presentation] ヒストンメチル化酵素SETDB1のモノクローナル抗体の作製と脂肪細胞分化におけるChIP Seq解析と翻訳後修飾解析 (2012)
  • Author(s): 吉田文乃、松村欣宏、馬郡健太、稲垣毅、深見希代子、酒井寿郎
  • Organizer: 第35回日本分子生物学会年会
• [Presentation] Jhdm1bによる脂肪細胞分化制御 (2012)
  • Author(s): 稲垣毅、岩崎聡、川村猛、田中十志也、松村欣宏、酒井寿郎
  • Organizer: 第35回日本分子生物学会年会
• [Presentation] SetdYによる間葉系細胞の分化制御 (2012)
  • Author(s): 山崎あゆむ、松村欣宏、藤橋ひとみ、野出孝一、稲垣毅、酒井寿郎
  • Organizer: 第35回日本分子生物学会年会
• [Presentation] ChIP sequence法を用いた代謝関連Jmjd1a標的遺伝子の解析 (2012)
  • Author(s): 中村加奈子、稲垣毅、松村欣宏、深見希代子、酒井寿郎
  • Organizer: 第35回日本分子生物学会年会
• [Presentation] 脂肪細胞分化におけるヒストンメチル化酵素Setdb1の役割 (2012)
  • Author(s): 松村 欣宏
  • Organizer: 第9回 FAT DM研究会
  • Place of Presentation: 山の上ホテル（東京都）
• [Presentation] ヒストンメチル化酵素SETB1 のモノクローナル抗体の作製と脂肪細胞分化におけるChIP Seq 解析と翻訳後修飾解析 (2012)
  • Author(s): 吉田 文乃、松村 欣宏、馬郡 健太、稲垣 毅、深見 希代子、酒井 寿郎
  • Organizer: 第35回 日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場
• [Presentation] Jhdm1bによる脂肪細胞分化制御 (2012)
  • Author(s): 稲垣 毅、岩崎 聡、川村 猛、田中 十志也、松村 欣宏、酒井 寿郎
  • Organizer: 第35回 日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場
• [Presentation] SetdYによる間葉系細胞の分化制御 (2012)
  • Author(s): 山崎 あゆむ、松村 欣宏、藤橋 ひとみ、野出 孝一、稲垣 毅、酒井 寿郎
  • Organizer: 第35回 日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場
• [Presentation] ChIP sequence 法を用いた代謝関連Jmjd1a 標的遺伝子の解析 (2012)
  • Author(s): 中村 加奈子、稲垣 毅、松村 欣宏、深見 希代子、酒井 寿郎
  • Organizer: 第35回 日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場