Development of an analytical system for the high sensitive detection of point mutation in oncogene

• Project/Area Number: 24750075
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Research Field: Analytical chemistry
• Research Institution: Tokyo University of Pharmacy and Life Science
• Principal Investigator: KOTANI Akira 東京薬科大学, 薬学部, 講師 (40318184)
• Project Period (FY): 2012-04-01 – 2014-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2013)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2013: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000); Fiscal Year 2012: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
• Keywords: 遺伝子多型 / 電気分析化学 / 変異検出法 / 液体クロマトグラフィー / 大腸癌

Research Abstract

High-performance liquid chromatography with electrochemical detection (HPLC-ECD) using boron-doped diamond (BDD) electrode was developed to perform the mutation detection assay based on the ligase detection reaction (LDR), which can distinguish low-abundant mutant DNA from abundant wild-type DNA. The performance of the present HPLC-ECD was examined to separate and detect an oligonucleotide which was produced by LDR. By the present HPLC-ECD, the LDR product derived from KRAS codon 12.2 mutations was detected.

Research Products

• [Journal Article] Simultaneous Detection of 19 K-ras Mutations by Free-solution Conjugate Electrophoresis of Ligase Detection Reaction Products on Glass Microchips (2013)
  • Author(s): J.C. Albrecht, A. Kotani, J.S. Lin, S.A. Soper, A.E. Barron
  • Journal Title: Electrophoresis Volume: 34 Issue: 4 Pages: 590-597
  • DOI: 10.1002/elps.201200462
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Capillary Liquid Chromatography with UV Detection Using <i>N</i>,<i>N</i>-Diethyl Dithiocarbamate for Determining Platinum-Based Antitumor Drugs in Plasma (2012)
  • Author(s): Y. Otsuki, A. Kotani, F. Kusu
  • Journal Title: Chemical and Pharmaceutical Bulletin Volume: 60 Issue: 5 Pages: 665-669
  • DOI: 10.1248/cpb.60.665
  • NAID: 130001852464
  • ISSN: 0009-2363, 1347-5223
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] EndoV/DNA Ligase Mutation Scanning Assay Using Microchip Capillary Electrophoresis and Dual-color Laser-induced Fluorescence Detection (2012)
  • Author(s): A. Kotani, M.A. Witek, J.K. Osiri, H. Wang, R. Sinville, H. Pincas, F. Barany, S.A. Soper
  • Journal Title: Anal. Methods Volume: 4 Issue: 1 Pages: 58-64
  • DOI: 10.1039/c1ay05366c
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 血中ノビレチン定量のためのダイヤモンド電極を用いた電気化学検出キャピラリーLC (2013)
  • Author(s): 永見昂太, 菅原康仁, 高橋浩司, 小谷明, 楠文代
  • Organizer: 第11回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム(PPF 2013)
  • Place of Presentation: 清水テルサ(静岡)
  • Year and Date: 2013-08-30
• [Presentation] UV-VIS検出HPLCを用いるリガーゼ検出反応生成物の分析法の開発 (2013)
  • Author(s): 小谷明, 大塚賢司, 村山遥佳, 袴田秀樹, 楠文代
  • Organizer: 日本薬学会第133年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(横浜)
  • Year and Date: 2013-03-28
• [Presentation] 血中ノビレチン定量のためのダイヤモンド電極を用いた電気化学検出キャピラリーLC (2013)
  • Author(s): 永見昂太、菅原康仁、高橋浩司、小谷 明、楠 文代
  • Organizer: 第11回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム(PPF 2013）
  • Place of Presentation: 清水テルサ
• [Presentation] UV-VIS検出HPLCを用いるリガーゼ検出反応生成物の分析法の開発 (2013)
  • Author(s): 小谷 明、大塚賢司、村山遥佳、袴田秀樹、楠 文代
  • Organizer: 日本薬学会第133 年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜（神奈川）
• [Presentation] 核酸塩基とssDNAの電気化学検出法の開発 (2012)
  • Author(s): 村山遥佳, 小谷明, 楠文代
  • Organizer: 第56回日本薬学会関東支部大会
  • Place of Presentation: 昭和大学旗の台キャンパス(東京)
  • Year and Date: 2012-10-13
• [Presentation] ボロンドープダイヤモンド電極を用いた核酸塩基とssDNAのボルタンメトリー (2012)
  • Author(s): 村山遥佳, 小谷明, 楠文代
  • Organizer: 第25回バイオメディカル分析科学シンポジウム(BMAS 2012)
  • Place of Presentation: 慶応大学芝共立キャンパス(東京)
  • Year and Date: 2012-08-08
• [Presentation] ボロンドープダイヤモンド電極を用いたシタラビンの電気化学検出HPLC (2012)
  • Author(s): 鳥井駿佑, 小谷明, 楠文代
  • Organizer: 第10回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム(PPF 2012)
  • Place of Presentation: ホテル平安の森京都(京都)
  • Year and Date: 2012-08-07
• [Presentation] ボロンドープダイヤモンド電極を用いた核酸塩基とssDNAのボルタンメトリー (2012)
  • Author(s): 村山遥佳、小谷 明、楠 文代
  • Organizer: 第25回バイオメディカル分析科学シンポジウム（BMAS 2012）
  • Place of Presentation: 慶応大学芝共立キャンパス（東京）