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Mechanism-based crosslinkers of acyl carrier protein dehydratase

Research Project

Project/Area Number 24810015
Research Category

Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Living organism molecular science
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

ISHIKAWA Fumihiro  京都大学, 生理化学研究ユニット, 助教 (50631553)

Project Period (FY) 2012-08-31 – 2014-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2013)
Budget Amount *help
¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2012: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords生合成 / 脂肪酸合成酵素 / ポリケタイド合成酵素 / パンテテインアナログ / タンパク質-タンパク質相互作用 / 不可逆的阻害剤 / タンパク質-タンパク質相互作用解析
Research Abstract

We reported the design, synthesis, and application of sulfonyl 3-alkynyl pantetheinamides that can cross-link acyl carrier proteins (ACPs) with beta-hydroxy-ACP dehydratase (DH) domains. This cross-linking strategy provides potential to investigate these enzymes in their native binding states by offering easy access to mechanistically cross-linked enzyme species.

Report

(3 results)
  • 2013 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2012 Annual Research Report
  • Research Products

    (23 results)

All 2014 2013 2012 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (16 results) (of which Invited: 2 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

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    • Author(s)
      Kengo Miyamoto, Fumihiro Ishikawa, Shinya Nakamura, Yutaka Hayashi, Isao Nakanishi, Hideaki Kakeya
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem.

      Volume: 22 Issue: 8 Pages: 2517-2528

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2014.02.031

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      Fumihiro Ishikawa, Hideaki Kakeya
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. Lett.

      Volume: 24 Issue: 3 Pages: 865-869

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2013.12.082

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      Chi Nguyen, Robert W. Haushalter, D.John Lee, Phineus R.L.Markwick, Joel Bruegger, Grace Caldara-Festin, Kara Finzel, David R.Jackson, Fumihiro Ishikawa, Bing O'Dowd, J.Andrew McCammon, Stanley J.Opella, Shiou-Chuan Tsai, Michael D.Burkart
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 505 Issue: 7483 Pages: 427-431

    • DOI

      10.1038/nature12810

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      Fumihiro Ishikawa, Robert W.Haushalter, D.John Lee, Kara Finzel, and Michael D.Burkart
    • Journal Title

      J. Am. Chem. Soc.

      Volume: 135 Issue: 24 Pages: 8846-8849

    • DOI

      10.1021/ja4042059

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      ファルマシア

      Volume: 48 Pages: 658-662

    • NAID

      110009901121

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      石川文洋,荒木通啓,掛谷秀昭
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  • [Remarks]

    • URL

      http://www.pharm.kyoto-u.ac.jp//sc-molsci/

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URL: 

Published: 2012-11-27   Modified: 2019-07-29  

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