Intra-complex crosstalk within a super nucleoprotein structure during initiation of chromosomal DNA replication

• Project/Area Number: 24870021
• Research Category: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Molecular biology
• Research Institution: Kyushu University
• Principal Investigator: KAWAKAMI Hironori 九州大学, 薬学研究科(研究院), 助教 (50403952)
• Project Period (FY): 2012-08-31 – 2014-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2013)
• Budget Amount: ¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000); Fiscal Year 2013: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2012: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
• Keywords: 染色体複製 / ORC / 相互作用様式 / 制御経路 / 多量生産システム / 多コピーサプレッサー / 情報解析 / 染色体DNA複製 / 相互作用

Research Abstract

An intra-complex crosstalk within ORC, an initiator of eukaryotic DNA replication, was analyzed extensively in vitro and in vivo. Inter-complex crosstalk pathways were also identified.

Research Products

• [Journal Article] Architecture of a helicase loading intermediate containing ORC-Cdc6-Cdt1-MCM2-7 on DNA reveals similarity to DNA polymerase clamp loading complexes (2013)
  • Author(s): Sun, J., Evrin, C., Samel, S., Fernández-Cid, A., Riera, A., Kawakami, H., Stillman, B., Speck , C., and Li, H.
  • Journal Title: Nat. Struct. Mol. Biol. Volume: 20(8) Pages: 944-951
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 出芽酵母pre-RC形成の精製組み換え蛋白質を用いた試験管内再構成とpre-IC構成因子のリクルートメント (2013)
  • Author(s): 川上広宣
  • Journal Title: Genes Genet. Syst. Volume: 87(5)(付録)(受賞記念総説) Pages: 7-7
• [Journal Article] Cryo-EM structure of a helicase loading intermediate containing ORC-Cdc6-Cdt1-MCM2-7 bound to DNA (2013)
  • Author(s): Sun, J., Evrin, C., Samel, S.A., Fernandez-Cid, A., Riera, A., Kawakami, H., Stillman, B., Speck, C., and Li, H.
  • Journal Title: Nature Structural and Molecular Biology Volume: 20 Issue: 8 Pages: 944-951
  • DOI: 10.1038/nsmb.2629
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A Replicase Clamp-Binding Dynamin-like Protein Promotes Colocalization of Nascent DNA Strands and Equipartitioning of Chromosomes in E. coli. (2013)
  • Author(s): Ozaki, S., Matsuda, Y., Keyamura, K., Kawakami, H., Noguchi, Y., Kasho, K., Nagata, K., Masuda, T., Sakiyama, Y., Katayama, T.
  • Journal Title: Cell Reports Volume: 4 Issue: 5 Pages: 985-995
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2013.07.040
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 出芽酵母pre-RC形成の精製組み換え蛋白質を用いた試験管内再構成とpre-IC構成因子のリクルートメント（受賞記念総説） (2013)
  • Author(s): 川上広宣
  • Journal Title: Genes Genet. Syst. Volume: 87(5)(付録) Pages: 7-7
• [Presentation] 大腸菌の増殖に必須な新奇非コード配列 (2014)
  • Author(s): 川上広宣、土田愛海、末次正幸、加生和寿、片山 勉
  • Organizer: 文部科学省科学研究費補助金 新学術領域研究（研究領域提案型）ゲノムを支える非コードDNA領域の機能 公開シンポジウム「インターメアによる染色体制御機構」
  • Place of Presentation: 東京大学山上会館
• [Presentation] 出芽酵母Orc1の構造変化特異的Orc6結合に必要な残基の同定 (2013)
  • Author(s): 川上広宣、片山勉
  • Organizer: 第22回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
  • Place of Presentation: 仙台
• [Presentation] 真核生物染色体DNA複製における最初期過程の構造生物学的・生化学的基盤 (2013)
  • Author(s): 川上広宣、片山勉、Bruce Stillman
  • Organizer: 第25回微生物シンポジウム
  • Place of Presentation: 静岡
• [Presentation] 精製組み換え蛋白質を用いて再構成した出芽酵母複製前複合体(pre-RC)の染色体複製開始における機能 (2013)
  • Author(s): 川上広宣、片山勉、Bruce Stillman
  • Organizer: 平成25年度日本生化学会九州支部例会
  • Place of Presentation: 佐賀県本庄町
• [Presentation] 大腸菌染色体の非コードDNA領域に存在し、細胞増殖に必須な新奇機能性配列ELIXIR (2013)
  • Author(s): 川上広宣、土田愛海、末次正幸、片山勉
  • Organizer: 第36回日本分子生物学会年会ワークショップ1AW4「ウェット個別研究とドライ研究の実践的超融合～新しい分子生物学のあり方を模索する」（オーガナイザー：川上広宣、加藤 護）
  • Place of Presentation: 神戸国際会議場、神戸国際展示場、神戸ポートピアホテル
  • Invited
• [Presentation] 出芽酵母Orc1の構造変化特異的Orc6結合に必要な残基の同定 (2013)
  • Author(s): 川上広宣、片山 勉
  • Organizer: 第22回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
  • Place of Presentation: ホテルニュー水戸屋（仙台市）
• [Presentation] Computational search for exceptional DNA elements at extremely long, intergenic regions in E. coli chromosome (2013)
  • Author(s): Kawakami, H., Tsuchida, A., Katayama, T.
  • Organizer: 日本バイオインフォマティクス学会2013年年会・第2回生命医薬情報学連合大会
  • Place of Presentation: タワーホール船堀（江戸川区）
• [Presentation] 真核生物染色体DNA複製における最初期過程の構造生物学的・生化学的基盤 (2013)
  • Author(s): 川上広宣 、片山 勉 、Bruce Stillman
  • Organizer: 第25回微生物シンポジウム
  • Place of Presentation: 静岡県立大学（駿河区）
• [Presentation] 大腸菌染色体上に点在する長い遺伝子間領域の体系的欠失解析 (2013)
  • Author(s): 土田愛海、川上広宣、末次正幸、片山 勉
  • Organizer: 第１０回２１世紀大腸菌研究会
  • Place of Presentation: 伊豆市
• [Presentation] 精製組み換え蛋白質を用いて再構成した出芽酵母複製前複合体(pre-RC)の染色体複製開始における機能 (2013)
  • Author(s): 川上広宣、片山勉、Bruce Stillman
  • Organizer: 平成２５年度日本生化学会九州支部例会
  • Place of Presentation: 佐賀大学（佐賀県本庄町）
• [Presentation] Conformational transition of a nucleoprotein complex at a yeast chromosomal replication origin revealed by cryo-electron microscopy (2012)
  • Author(s): Kawakami, H., Sun, J., Zech, J., Speck, C., Li, H., and Stillman, B.
  • Organizer: Kyushu University–Pusan University Joint Seminar
  • Place of Presentation: Fukuoka, Japan
  • Year and Date: 2012-09-17
• [Presentation] 精製組み換え蛋白質を用いて再構成した出芽酵母pre-RCが複製開始に及ぼす機能 (2012)
  • Author(s): 川上広宣、片山勉、Bruce Stillman
  • Organizer: 第85回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 福岡
• [Presentation] 出芽酵母pre-RC形成の精製組み換え蛋白質を用いた試験管内再構成とpre-IC構成因子のリクルートメント (2012)
  • Author(s): 川上広宣、Bruce Stillman
  • Organizer: 日本遺伝学会第84回大会ワークショップ
  • Place of Presentation: 福岡(Best Papers賞)
• [Presentation] 出芽酵母pre-RC形成の精製組み換え蛋白質を用いた試験管内再構成とpre-IC構成因子のリクルートメント (2012)
  • Author(s): 川上広宣
  • Organizer: 日本遺伝学会第８４回大会ワークショップ「原核生物に習う遺伝情報安定性の維持機構の原理」
  • Place of Presentation: 福岡
  • Invited
• [Presentation] 精製組み換え蛋白質を用いて再構成した出芽酵母pre-RCが複製開始に及ぼす機能 (2012)
  • Author(s): 川上広宣
  • Organizer: 第８５回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 福岡
• [Presentation] DnaA制御サイクルの再構築による解明：新たなDnaA-ATP加水分解経路と核様体構築因子の役割 (2012)
  • Author(s): 片山 勉
  • Organizer: 第85回日本生化学会大会 シンポジウム「細胞周期進行とゲノムの安定な維持を支える染色体イベントの酵素学的合成生物学的再構築による解明」
  • Place of Presentation: 福岡
• [Presentation] 大腸菌の開始複合体の解析から見えてきた基盤システム (2012)
  • Author(s): 片山 勉
  • Organizer: 第35回日本分子生物学会年会 ワークショップ「DNA複製機構とその制御---生物種を超えた統一的理解を目指して---」
  • Place of Presentation: 福岡
• [Presentation] Conformational transition of a nucleoprotein complex at a yeast chromosomal replication origin revealed by cryo-electron microscopy.
  • Author(s): Kawakami, H.
  • Organizer: Kyushu University - Pusan University Joint Seminar
  • Place of Presentation: 福岡
• [Remarks]
  • URL: http://bunsei.phar.kyushu-u.ac.jp/
• [Remarks] 分子生物薬学研究業績
  • URL: http://bunsei.phar.kyushu-u.ac.jp/BUNSEI-GYOUSEKI.html
• [Remarks] 分子生物薬学研究業績
  • URL: http://bunsei.phar.kyushu-u.ac.jp/BUNSEI-GYOUSEKI.html