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Initial host cell response to the plasmid recruited by conjugation

Research Project

Project/Area Number 24H00497
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Medium-sized Section 38:Agricultural chemistry and related fields
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

野尻 秀昭  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 教授 (90272468)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 細川 正人  早稲田大学, 理工学術院, 准教授(任期付) (60722981)
Project Period (FY) 2024-04-01 – 2028-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2025)
Budget Amount *help
¥47,840,000 (Direct Cost: ¥36,800,000、Indirect Cost: ¥11,040,000)
Fiscal Year 2025: ¥11,700,000 (Direct Cost: ¥9,000,000、Indirect Cost: ¥2,700,000)
Fiscal Year 2024: ¥12,740,000 (Direct Cost: ¥9,800,000、Indirect Cost: ¥2,940,000)
Keywords細菌 / プラスミド / 接合伝達 / トランスクリプトーム / フィットネス
Outline of Research at the Start

接合伝達後のプラスミドに対し、宿主細菌は自らの転写・代謝ネットワークを変化させて適応する。この結果として負荷の程度が決まり、プラスミドの安定性や競合条件での宿主の生残性が決定されるが、このメカニズムの理解は不十分である。本研究では、接合伝達直後の細胞を分離した後、少数細菌細胞用の最新のRNA-Seq解析でトランスクリプトーム変化を経時的に追跡する。また、接合伝達完了体での負荷の程度の評価とメタボローム解析も行う。得られたデータから、プラスミド受容後の動的な適応過程を今までにない高い網羅性・時間分解能で明らかにし、真に負荷の原因となる代謝(経路)・遺伝子などを同定する。

Report

(1 results)
  • 2024 Comments on the Screening Results

URL: 

Published: 2024-04-05   Modified: 2025-06-20  

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