Integrated single-cell analysis of phenotype and gene expression

Research Project

Project/Area Number	24K01318
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 28050:Nano/micro-systems-related
Research Institution	Kyoto University
Principal Investigator	新宅博文京都大学, 医生物学研究所, 教授 (80448050)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2027-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥18,590,000 (Direct Cost: ¥14,300,000、Indirect Cost: ¥4,290,000) Fiscal Year 2026: ¥7,410,000 (Direct Cost: ¥5,700,000、Indirect Cost: ¥1,710,000) Fiscal Year 2025: ¥5,590,000 (Direct Cost: ¥4,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000) Fiscal Year 2024: ¥5,590,000 (Direct Cost: ¥4,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000)
Keywords	1細胞 / マイクロ流体工学 / 電気泳動 / RNA-sequencing
Outline of Research at the Start	本研究では表現型と網羅的遺伝子発現を同時かつ大量の1細胞から取得する新規の1細胞マルチモーダル計測技術をナノ・マイクロ科学により開発し，それに基づいた大規模1細胞データの取得および統合解析により，従来の単一モダリティ計測では分離が困難であった細胞状態や遷移過程を顕在化させ，それらのパスウェイに対する重要な制御遺伝子の特定を可能にする．ここでは注目する表現型として細胞形態，細胞表面張力，細胞動態および運命決定を選択し，これら表現型と遺伝子発現の1細胞統合解析を通して，表現型の種類に関わらず適用できる一般化された統合解析アプローチを構築することで，当該分野の体系化に貢献する．