Development of a comprehensive quantitative method for post-transcriptional modifications of RNA

• Project/Area Number: 24K01517
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 34020:Analytical chemistry-related
• Research Institution: Tokyo Metropolitan University
• Principal Investigator: 田岡 万悟 東京都立大学, 理学研究科, 准教授 (60271160)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 中山 洋 国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 専任研究員 (80321793)
• Project Period (FY): 2024-04-01 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥18,590,000 (Direct Cost: ¥14,300,000、Indirect Cost: ¥4,290,000); Fiscal Year 2026: ¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000); Fiscal Year 2025: ¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000); Fiscal Year 2024: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
• Keywords: RNA / 質量分析 / 転写後修飾

Outline of Research at the Start

本研究では、in vivo標識と質量分析を組み合わせた、新たなRNA修飾変動解析法RNA-SILACを確立する。具体的な研究項目は以下の3つである。(i) RNAのin vivo標識法の確立/(ii) 質量分析データの解析ソフトウエアの検討と改良/(iii) RNA-SILAC法の適用例の創出。この方法を確立することで、刺激に応じたRNA転写後修飾の変動解析や転写後修飾を介したシグナル伝達のクロストーク研究などの研究分野の新展開が期待できる。