Transcriptome/Cistrome analysis of ethylene synthesis mutants to elucidate the regulation of fruit ripening

• Project/Area Number: 24K01747
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 39030:Horticultural science-related
• Research Institution: Okayama University
• Principal Investigator: 牛島 幸一郎 岡山大学, 環境生命自然科学学域, 教授 (20379720)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 柏本 知晟 和歌山県農林水産部(農業試験場、果樹試験場、畜産試験場、林業試験場及び水産試験場), 果樹試験場うめ研究所, 研究員 (10865489) ; 赤木 剛士 岡山大学, 環境生命自然科学学域, 教授 (50611919) ; 中野 龍平 京都大学, 農学研究科, 准教授 (70294444) ; 池田 和生 山形大学, 農学部, 准教授 (80555269) ; 河井 崇 岡山大学, 環境生命自然科学学域, 准教授 (90721134)
• Project Period (FY): 2024-04-01 – 2029-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥18,590,000 (Direct Cost: ¥14,300,000、Indirect Cost: ¥4,290,000); Fiscal Year 2028: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000); Fiscal Year 2027: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000); Fiscal Year 2026: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000); Fiscal Year 2025: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000); Fiscal Year 2024: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
• Keywords: 果実成熟 / エチレン / cistrome / transcriptome / methylome

Outline of Research at the Start

エチレンによって制御される果実成熟の人為的な制御は果実品質や貯蔵・流通性の向上を図る上で非常に重要である。エチレンは強力な植物ホルモンであるため果実品質以外に関わる遺伝子も大きく変化し、単純なtranscriptome解析をするだけでは真に重要な遺伝子の特定は困難である。本研究ではメロンやモモ、ウのエチレン合成不全変異体を解析対象とし、transcriptome解析とDNAのメチル化やAIを利用したcis-elementの特定と言ったcistrome解析を行う。これらの解析から果実成熟の最初期の反応を正確に把握し、個々の成熟形質を制御する遺伝子の発現制御ネットワークを特定する。