Study of a molecular network to realize various gene expression waves

• Project/Area Number: 24K01771
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 39050:Insect science-related
• Research Institution: Osaka Medical and Pharmaceutical University
• Principal Investigator: 小田 康子 (秋山康子) 大阪医科薬科大学, 医学部, 非常勤講師 (80426650)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 小田 広樹 株式会社生命誌研究館, その他部局等, 主任研究員 (50396222) ; 藤原 基洋 株式会社生命誌研究館, その他部局等, 奨励研究員 (10896872)
• Project Period (FY): 2024-04-01 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥18,590,000 (Direct Cost: ¥14,300,000、Indirect Cost: ¥4,290,000); Fiscal Year 2026: ¥6,240,000 (Direct Cost: ¥4,800,000、Indirect Cost: ¥1,440,000); Fiscal Year 2025: ¥6,240,000 (Direct Cost: ¥4,800,000、Indirect Cost: ¥1,440,000); Fiscal Year 2024: ¥6,110,000 (Direct Cost: ¥4,700,000、Indirect Cost: ¥1,410,000)
• Keywords: パターン形成 / 遺伝子ネットワーク / ヘッジホッグ シグナル / 単一核RNA-seq / クモ

Outline of Research at the Start

オオヒメグモ胚では、体節の縞パターンは体の３領域で異なる動態を示す遺伝子発現の波により形成される。本研究では、正常胚とRNAi胚を継時的にサンプリングして単一核データを取得し、波と関連して発現する遺伝子を同定し、その機能解析と数理的な解析から、多様な波を作る細胞の状態とゲノムに書かれた分子ネットワークの解明を目指す。これによりクモ胚の領域による多様性と、昆虫の発生様式との本質的な違いを明らかにする。