Conservation genomics of endangered amphibians from the South-West Islands in Japan by elucidating recessive deleterious mutations

• Project/Area Number: 24K01783
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 39060:Conservation of biological resources-related; Basic Section 39070:Landscape science-related; Sections That Are Subject to Joint Review: Basic Section39060:Conservation of biological resources-related , Basic Section39070:Landscape science-related
• Research Institution: Hiroshima University
• Principal Investigator: 井川 武 広島大学, 両生類研究センター, 准教授 (00507197)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 荻野 肇 広島大学, 両生類研究センター, 教授 (10273856) ; 鈴木 誠 広島大学, 両生類研究センター, 助教 (10533193)
• Project Period (FY): 2024-04-01 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥18,590,000 (Direct Cost: ¥14,300,000、Indirect Cost: ¥4,290,000); Fiscal Year 2026: ¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000); Fiscal Year 2025: ¥5,590,000 (Direct Cost: ¥4,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000); Fiscal Year 2024: ¥9,490,000 (Direct Cost: ¥7,300,000、Indirect Cost: ¥2,190,000)
• Keywords: 両生類 / ゲノミクス / 絶滅危惧種 / 遺伝的多様性 / 劣勢有害変異

Outline of Research at the Start

本研究は劣勢有害変異の実態解明を基軸として、西南諸島絶滅危惧・天然記念物両生類６種について時系列サンプルを含めたゲノム解読・集団ゲノミクスにより、持続的な保全方策に資する遺伝情報の全貌を得ることを目的とする。
ゲノムは生物の進化史の記録であるとともに、将来への進化的可塑性を担保する唯一無二の実存物である。本研究では両生類モデル生物であるネッタイツメガエルを利用して劣勢有害変異の実態について理解し、緊急性の高い西南諸島産絶滅危惧種についてゲノムを決定することで実際のリスクを検証する。これによって、将来の絶滅リスク予測と効率的・持続的保全方策への基礎的情報を提供することを最終的な目標とする。