Structure-function analysis of transcription elongation/termination complexes using a new method capable of analyzing multifactor complexes

Research Project

Project/Area Number	24K02003
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 43050:Genome biology-related
Research Institution	Tokyo Institute of Technology
Principal Investigator	山口雄輝東京工業大学, 生命理工学院, 教授 (50345360)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2027-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥18,590,000 (Direct Cost: ¥14,300,000、Indirect Cost: ¥4,290,000) Fiscal Year 2026: ¥5,590,000 (Direct Cost: ¥4,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000) Fiscal Year 2025: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000) Fiscal Year 2024: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Keywords	転写複合体 / proximity labeling
Outline of Research at the Start	本研究の目的は、ダイナミックに組成が変化する多因子複合体を解析可能な新手法を用いて転写サイクルを高精細に描き出すことである。すなわち近位依存性ラベリング反応を行うAPEXとTurboIDを組み合わせて2つの因子が共存する複合体のみを解析する手法を開発し、本手法を活かして特に転写伸長・終結とmRNAプロセシングが同時進行する転写伸長複合体のダイナミックなリモデリング過程を明らかにする。比較プロテオーム解析と次世代シーケンス解析によって得られる「構造」解析を相補するため、機能的な遺伝学スクリーニングも実施し、転写終結・3’プロセシング部位の選択機構に関する包括的な基盤情報を得る。