Unraveling the comprehensive picture of expression constraints mechanisms with the new expression system gTOW2.0

• Project/Area Number: 24K02013
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 43060:System genome science-related
• Research Institution: Okayama University
• Principal Investigator: 守屋 央朗 岡山大学, 環境生命自然科学学域, 教授 (60500808)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 牧野 能士 東北大学, 生命科学研究科, 教授 (20443442) ; 山本 泰生 静岡大学, 情報学部, 准教授 (30550793)
• Project Period (FY): 2024-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥18,460,000 (Direct Cost: ¥14,200,000、Indirect Cost: ¥4,260,000); Fiscal Year 2027: ¥5,330,000 (Direct Cost: ¥4,100,000、Indirect Cost: ¥1,230,000); Fiscal Year 2026: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000); Fiscal Year 2025: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000); Fiscal Year 2024: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
• Keywords: 酵母 / 過剰発現 / 発現制約 / タンパク質毒性

Outline of Research at the Start

本研究は4年間で行う。最初の2年で酵母の第1染色体92種類のタンパク質を解析し、仮説を検証する。この数は96穴プレートの1単位であり、仮説検証に必要な多様性もある。3年目以降、広く全体像を明らかにするため標的を拡張する（最終目標は全タンパク質）。数理モデルは2年で原型を作り継続して改良続ける。成果は3年目から論文化する。本研究の実験は代表者と研究室メンバー（院生2名、補助員1名）が、検証仮説の提案は生物情報学が専門の分担者・牧野と、モデル構築は情報工学が専門の分担者・山本とで行う。