炎症性腸疾患関連癌のDNAメチル化解析とcfDNAを用いた早期診断システムの開発

• Project/Area Number: 24K02517
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 55020:Digestive surgery-related
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 石原 聡一郎 東京大学, 医学部附属病院, 教授 (00376443)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 佐々木 和人 東京大学, 医学部附属病院, 講師 (00781238) ; 横山 雄一郎 東京大学, 医学部附属病院, 助教 (20880222) ; 品川 貴秀 東京大学, 医学部附属病院, 助教 (20972706) ; 江本 成伸 東京大学, 医学部附属病院, 助教 (30803267) ; 室野 浩司 東京大学, 医学部附属病院, 講師 (70773951) ; 野澤 宏彰 東京大学, 医学部附属病院, 准教授 (80529173)
• Project Period (FY): 2024-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥18,460,000 (Direct Cost: ¥14,200,000、Indirect Cost: ¥4,260,000); Fiscal Year 2027: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000); Fiscal Year 2026: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000); Fiscal Year 2025: ¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000); Fiscal Year 2024: ¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000)
• Keywords: 炎症性腸疾患関連癌 / DNAメチル化解析

Outline of Research at the Start

我々はこれまでに多種類の癌において、独自のメチル化パネル作成技術を用いて人工知能（AI）により血中cell-free DNA（cfDNA）を解析する、癌早期診断ツールの開発を行ってきた。炎症性腸疾患に合併する消化管癌（IBD関連癌）におけるDNAのメチル化パターンは散発性癌とは異なっている可能性があり、本研究ではまず、IBD関連癌の網羅的メチル化解析を行い、散発性大腸癌のメチル化プロファイルとの比較を行い、その違いを明らかにしたい。引き続いて、メチル化マーカーの候補からcfDNA検出用のメチル化パネルを作成し、患者血液検体を用いてAI診断モデルを作成し、さらにはその性能を検証する予定である。