Diagnostics of methylation-based predictive biomarkers in ovarian and endometrial carcinomas by using both tumors and liquid biopsy

• Project/Area Number: 24K02584
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 56040:Obstetrics and gynecology-related
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 織田 克利 東京大学, 医学部附属病院, 教授 (30359608)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 河津 正人 千葉県がんセンター(研究所), がん治療開発グループ 細胞治療開発研究部, 部長 (20401078) ; 山本 陽子 東京大学, 医学部附属病院, 特任研究員 (30376644) ; 田口 歩 東京大学, 医学部附属病院, 届出研究員 (60756782) ; 曾根 献文 東京大学, 医学部附属病院, 准教授 (90598872)
• Project Period (FY): 2024-04-01 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥18,590,000 (Direct Cost: ¥14,300,000、Indirect Cost: ¥4,290,000); Fiscal Year 2026: ¥6,110,000 (Direct Cost: ¥4,700,000、Indirect Cost: ¥1,410,000); Fiscal Year 2025: ¥6,110,000 (Direct Cost: ¥4,700,000、Indirect Cost: ¥1,410,000); Fiscal Year 2024: ¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
• Keywords: エピゲノム / メチル化判定 / リキッド・バイオプシー / 卵巣癌 / 子宮体癌

Outline of Research at the Start

エピゲノム修飾の変化と薬剤感受性の関係性に注目し、HRDやMSI-H群においてDNAメチル化症例を正確に層別化するとともに、薬剤耐性に関わる主要遺伝子のメチル化状態を同時に評価することで、臨床応用可能なメチル化診断法の確立を目指す。
具体的には、卵巣癌・子宮体癌の腫瘍検体を用いて、BRCA1, MLH1等のメチル化とMSIを同時に調べるアッセイ法（SiFAMM法）として、「薬剤感受性メチル化診断パネル（新SiFAMM法）」を開発する。
Liquid Biopsyを用いて経時的にメチル化を評価する「メチル化リアルタイムモニタリング法（Liquid SiFAMM法）」へと発展させ、実用化を目指す。