Data-driven prediction of bacterial interaction networks based on growth kinetics.

Research Project

Project/Area Number	24K08168
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 27040:Biofunction and bioprocess engineering-related
Research Institution	Yokohama National University
Principal Investigator	鈴木市郎横浜国立大学, 大学院工学研究院, 講師 (90303081)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2027-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000) Fiscal Year 2026: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000) Fiscal Year 2025: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000) Fiscal Year 2024: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords	マイクロバイオーム / データ駆動型解析 / 比増殖速度 / 相互作用ネットワーク / 硝化細菌
Outline of Research at the Start	伝統的発酵産業や排水処理、環境浄化など、多様な微生物から成る「微生物叢」を用いたバイオプロセスは様々に利用されている。本研究では、硝化細菌群集を用いたアンモニア除去プロセスを対象に、申請者らがすでに構築した細菌叢組成の時系列データから各細菌の増殖パラメータを求める解析法を基に、細菌叢内で増殖する各細菌間の相互作用ネットワークを可視化する、簡便かつ新たなデータ駆動型のマイクロバイオーム解析法を構築する。それにより、微生物叢を用いたバイオプロセスの機構をより深く考察し、その効率化・高機能化に寄与することを目指す。