RNAポリメラーゼと基本転写因子TFIIHの特異的相互作用の普遍性と特異性

Research Project

Project/Area Number	24K09354
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 43020:Structural biochemistry-related
Research Institution	Yokohama City University
Principal Investigator	奥田昌彦横浜市立大学, 生命医科学研究科, 特任准教授 (60448686)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2027-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000) Fiscal Year 2026: ¥390,000 (Direct Cost: ¥300,000、Indirect Cost: ¥90,000) Fiscal Year 2025: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000) Fiscal Year 2024: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
Keywords	基本転写因子 / RNAポリメラーゼ / タンパク質間相互作用 / 立体構造 / NMR
Outline of Research at the Start	先ず個々のタンパク質のNMR構造を解析する。TFIIHのヒトp62の分裂酵母ホモログTfb1のPHドメインの構造決定は完了しているので、分裂酵母RNAポリメラーゼ(RNAP)のRPB6の構造を解く。次に、分裂酵母RNAPのRPB6とTFIIH Tfb1のPHドメインの複合体構造を決定する。複合体構造から示唆される特異的相互作用に重要なアミノ酸に変異を導入し、NMRやITCで結合実験を行い構造の妥当性を評価する。最後に、分裂酵母の認識機構と前研究で解明したヒトのものを比較検討し、RNAPとTFIIHとの間の特異的相互作用の普遍性がヒトと酵母でどのように類似し異なっているのかを構造から説明する。