保存された遺伝子クラスターの網羅的探索に基づく水平移動遺伝子の包括的動態解析

Research Project

Project/Area Number	24K09418
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 43050:Genome biology-related
Research Institution	National Institute for Basic Biology
Principal Investigator	内山郁夫基礎生物学研究所, ゲノム情報研究室, 准教授 (90243089)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2027-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000) Fiscal Year 2026: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000) Fiscal Year 2025: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000) Fiscal Year 2024: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywords	遺伝子水平移動 / ゲノミックアイランド / コアゲノム / 比較ゲノム
Outline of Research at the Start	微生物の多様性を生み出すしくみとして遺伝子の水平移動に着目し、そのゲノム上の痕跡であるゲノミックアイランドの動態を比較ゲノム解析により解明する。この目的のため、ゲノム上の遺伝子の並びが種内で保存された構造を、種内全体で共有される「コアゲノム」と、一部の株のみで共有される短い「アイランド」に分けて抽出し、それらの並び順を異種間で網羅的に比較する。これを用いて、どのような遺伝子群が、どのような生物種間で移動しているかを解析し、普遍的な特徴を抽出できるかを検討する。