Searching for causative gene variants in multisystem neurodegenerative diseases using small family samples

Research Project

Project/Area Number	24K09547
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 45010:Genetics-related
Research Institution	Saitama Medical University
Principal Investigator	嶋崎晴雄埼玉医科大学, 保健医療学部, 教授 (30316517)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2027-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000) Fiscal Year 2026: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000) Fiscal Year 2025: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000) Fiscal Year 2024: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords	神経変性疾患 / 連鎖解析 / 全エクソーム解析 / 全ゲノム解析
Outline of Research at the Start	臨床症状のみからは変異のある候補遺伝子の決定が困難な，多系統に渡る遺伝性神経変性疾患の原因遺伝子変異の同定を試みる。一名のみの候補遺伝子解析や全エクソーム解析で原因遺伝子変異が同定できなかった家系にて、家系内の複数の検体を用いた連鎖解析を行う。また、患者検体を用いて全ゲノム解析、RNAシーケンス解析、マイクロアレイ解析など行い，エクソン内の非同義置換や，スプライス変異などを検索する。同定された場合、それらが真の病的変異かどうか、家系内共分離の確認，コンピュータープログラムを用いた機能変化予測や構造変化予測，各種培養細胞などを用いて機能解析を行い病原性の確定を行い，病原遺伝子変異の同定を試みる．