嫌気/好気両条件下での基質応答を鍵とした未知遺伝子機能の解明

Research Project

Project/Area Number	24K09609
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 45040:Ecology and environment-related
Research Institution	Kochi University
Principal Investigator	若松泰介高知大学, 教育研究部総合科学系生命環境医学部門, 准教授 (60597938)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	諸野祐樹国立研究開発法人海洋研究開発機構, 超先鋭研究開発部門(高知コア研究所), 上席研究員 (30421845)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2027-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000) Fiscal Year 2026: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000) Fiscal Year 2025: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000) Fiscal Year 2024: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Keywords	遺伝子機能 / 海底下微生物 / メタゲノム法 / DNA
Outline of Research at the Start	まず、様々な海底下堆積物を用いて作製したSIGEXライブラリーから、海底下環境に代表的なハロゲン化合物やメタン代謝経路化合物、金属イオンなどに応答するDNA断片を取得する。次に、応答クローンの基質応答特異性解析を行う。さらに、メタゲノム配列解析により応答DNA断片のゲノムでの周辺情報を電子的に抽出する。応答DNA断片の欠損変異体解析による基質応答因子領域の同定と推定上新規転写因子の生化学的解析も行う。これらにより、海底下微生物の未知遺伝子機能を解明し、塩基配列解析全盛の現在に対し実験的遺伝子機能解析の重要性を提唱する。