Spatial transcriptome analyses and biomarker development of superficial esophageal squamous cell carcinomas

• Project/Area Number: 24K10138
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 49020:Human pathology-related
• Research Institution: Tokyo Medical and Dental University
• Principal Investigator: 大橋 健一 東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 教授 (40231203)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 山本 浩平 東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 講師 (50451927) ; 山本 くらら 東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 助教 (90899973)
• Project Period (FY): 2024-04-01 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2026: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000); Fiscal Year 2025: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000); Fiscal Year 2024: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
• Keywords: 食道がん / 扁平上皮がん / 早期がん / 空間トランスクリプトーム解析 / 上皮間葉転換

Outline of Research at the Start

本研究は多数の表在型食道扁平上皮がん手術例、内視鏡切除例、生検例を対象とした研究であり、病理学的所見、リンパ節転移の有無、再発、予後などの臨床病理学的情報を含むデータベースを活用する。①表在型食道がんBudding胞巣に対する空間トランスクリプトーム解析、②多数の表在型食道がん例を用いたバイオマーカー候補の検証、③がん浸潤の新評価法、バイオマーカーの内視鏡切除例、生検例への応用を計画している。