膀胱癌組織中の細菌叢形成が及ぼす遺伝子発現変化に着目した新規バイオマーカーの開発

• Project/Area Number: 24K10142
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 49020:Human pathology-related
• Research Institution: Osaka University
• Principal Investigator: 藤井 智美 大阪大学, 大学院医学系研究科, 寄附講座准教授 (50623477)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 本山 雄一 大阪大学, 大学院医学系研究科, 寄附講座助教 (60948074) ; 三宅 牧人 奈良県立医科大学, 医学部, 講師 (80601400) ; 内山 智子 奈良県立医科大学, 医学部, 助教 (80745448) ; 清川 博貴 大阪大学, 大学院医学系研究科, 寄附講座助教 (90973785)
• Project Period (FY): 2024-04-01 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2026: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2025: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000); Fiscal Year 2024: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
• Keywords: 膀胱癌 / マイクロバイオーム解析 / NGS / マイクロRNA / 16s rRNA

Outline of Research at the Start

膀胱癌における種々の危険因子への持続的暴露に加え、膀胱癌病巣に形成される細菌叢による微小環境の変化を想定し、本研究では、1)病理組織学的に膀胱癌組織中の細菌の存在と炎症細胞浸潤の程度を評価する、2)次世代シークエンサー(Next generation sequencing; NGS)を用いて、膀胱癌組織の16s rRNA遺伝子解析を行う、3）膀胱癌細胞株を用いてmicroRNA(miRNA)やその標的分子と病巣周囲に存在する菌種との関連を見出すために分子機能解析を行い、細菌叢関連バイオマーカーの開発を目指す。