Genomic conformational changes in a pathological model using iPS cells derived from patients with chromosome deletion syndrome

• Project/Area Number: 24K11035
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 52050:Embryonic medicine and pediatrics-related
• Research Institution: Institute of Physical and Chemical Research
• Principal Investigator: 高崎 真美 国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソース研究センター, 開発研究員 (80392009)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 林 洋平 国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソース研究センター, チームリーダー (90780130)
• Project Period (FY): 2024-04-01 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2026: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2025: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2024: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
• Keywords: 染色体欠失症候群 / iPS細胞 / 神経堤細胞

Outline of Research at the Start

多様な臨床像を示す「染色体欠失症候群」において、数Mbに及ぶ欠失領域に存在する複数の遺伝子や発現調節配列が、各症状の発症にどのように関連するかは十分に理解されていない。本課題では、4p欠失症候群と22q11.2欠失症候群患者由来iPS細胞株を用い、病態モデルの開発と発症機序の解明を目指す。両症候群の主症状である特徴的顔貌や口蓋裂は、発生初期に生じる神経堤細胞の異常に起因する。よって本課題では、疾患iPS細胞より神経堤細胞を誘導して病態モデルを確立する。さらに本研究では、染色体立体配座捕捉法（Hi-C解析）を実施して神経堤発生時の染色体構造変化と病態との関連性を明らかにする。