遺伝子の構造及びタンパク安定性評価に基づく心筋症原因バリアント評価手法の確立

Research Project

Project/Area Number	24K11307
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 53020:Cardiology-related
Research Institution	National Cardiovascular Center Research Institute
Principal Investigator	宮下洋平国立研究開発法人国立循環器病研究センター, 病院, 室長 (60816312)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2027-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000) Fiscal Year 2026: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000) Fiscal Year 2025: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000) Fiscal Year 2024: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords	機能喪失型変異 / バイオインフォマティクス / Gibbs自由エネルギー
Outline of Research at the Start	心筋症（特に拡張型心筋症）はゲノム解析を行った際に、SNVやShort In/Delに着目したバリアント評価ではVUS（意義不明バリアント）が非常に多く判断に難渋することが多い。そこで本研究ではVUSに対して機能喪失型/機能獲得型バリアントであるかを判定するためのアルゴリズムの開発を行う。バリアントの存在によりタンパク構造の安定性が変化することに着目し、Gibbs自由エネルギーの増減とバリアントの３次元的なポジション情報などから機能喪失型/機能獲得型を評価するモデルを構築する。このモデルを申請者らが保有する日本人大規模心筋症ゲノムコホートに適用して、心筋症病態の層別化を目指す。