Spatial single cell analysis in Merkel cell carcinoma to elucidate the optimal microenvironment for immunotherapy

• Project/Area Number: 24K11502
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 53050:Dermatology-related
• Research Institution: Nagoya City University
• Principal Investigator: 中村 元樹 名古屋市立大学, 医薬学総合研究院(医学), 准教授 (70645051)
• Project Period (FY): 2024-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2027: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000); Fiscal Year 2026: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000); Fiscal Year 2025: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000); Fiscal Year 2024: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
• Keywords: メルケル細胞癌 / 免疫チェックポイント阻害薬 / バイオマーカー / 腫瘍免疫微小環境

Outline of Research at the Start

協力施設から集積したMCCの腫瘍サンプル計50例を、PhenoCycler (AKOYA Biosciences)を用いて、最大40色の蛍光多重免疫染色を行い、シングルセルレベルでの画像解析から腫瘍微小環境を明らかにする。Heterogeneityを持つ腫瘍細胞と、組織中に入り込む血管やリンパ管網、周囲の線維芽細胞、そして浸潤する様々な免疫細胞を、その組成や局在、細胞間の距離と相互作用を解析し、予後、ICIに対する奏効率、MCPyV感染の有無、先に述べたPD-L1, G6PD, TLSなどのバイオマーカー発現の有無で比較し、違いを見つけることで、より理想的な腫瘍免疫微小環境とは何かを探索する。