Development of strain identification and phylogenetic classification methods for commensal and pathogenic fungi

Research Project

Project/Area Number	24K11631
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 54030:Infectious disease medicine-related
Research Institution	Osaka University
Principal Investigator	元岡大祐大阪大学, 微生物病研究所, 講師 (10636830)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2027-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000) Fiscal Year 2026: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000) Fiscal Year 2025: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000) Fiscal Year 2024: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords	真菌ゲノム解析
Outline of Research at the Start	クリニカルメタゲノミクスは、種々の病原体を検出できるだけでなく、検出した病原体の遺伝子型の同定、毒素遺伝子など原因遺伝子の同定や病原体ゲノム配列の決定も可能である。しかし、臨床検体中に含まれる病原体由来の核酸は、1%以下と非常に少ない。また、データベースに依存した解析手法であるため、ゲノム情報の少ない真菌の正確な同定ができていない。そこで本研究では、真菌感染症に焦点をあて、ヒトに関連する真菌の正確かつ迅速なゲノムの種・株同定法を確立する。