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Predictive bio-marker study of chemoradiation therapy for gastro-intestinal tract cancers by High-depth Omics

Research Project

Project/Area Number 24K11933
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 55020:Digestive surgery-related
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

森 隆弘  九州大学, 生体防御医学研究所, 共同研究員 (00323030)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 植野 和子  国立研究開発法人国立国際医療研究センター, 研究所, ゲノム医科学プロジェクト戸山プロジェクト 研究員 (00794512)
長崎 正朗  九州大学, 生体防御医学研究所, 教授 (90396862)
Project Period (FY) 2024-04-01 – 2027-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2026: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywordsマルチオミックス解析 / 食道癌 / 術前化学療法後 / 化学放射療法 / 免疫チェックポイント阻害薬 / 効果予測因子 / 予後因子 / 直腸癌 / 化学放射線療法 / 治療効果予測因子 / 高深度オミクス解析
Outline of Research at the Start

本研究の目的は食道癌及び直腸癌に対するCRTの効果予測因子を確立することである。その目的のため、申請者がこれまで行ってきたオミクス解析にて得られた結果を元に、各一細胞レベルにおいて、精緻なオミクス解析を行う。測定系であるseqFISH法は、約7,000遺伝子のmRNAに対して測定可能なプローブ群と測定プロトコルを分担研究者の長﨑が設計、さらに、研究協力者大川恭行教授が設計した自動測定装置でmRNAの一細胞毎時空間定量発現測定を行う。上述した、申請者が報告した遺伝子産物やその下流の遺伝子群、及び申請者が明らかにしたG2M期に関与する細胞周期蛋白群を含む200-400種類のプローブにより測定する。

Outline of Annual Research Achievements

ゲノム解析結果については論文にまとめ論文投稿中である(以下)。
A POLR1D-Regulating Single-Nucleotide Polymorphism as a Predictive Marker Candidate for Platinum-Based Chemotherapy in Gastrointestinal cancers. Mori T, Ueno K, Nagasaki M, et al. submitted.
上記データを元に特許申請し受理された。日本癌学会で発表も行った。さらに、新規のコホートにおいて全ゲノム創刊解析も行っており、新たな予後因子の探索を進めている。
切除標本を使用した一細胞レベルでのオミクス解析に関しては現在、標本集積中であり、解析結果はまだ出ていない。集積状況は予想を下回っているため、共同研究機関を追加し(東北医科薬科大学病院消化器外科及び病理)、標本集積を加速させるべく努力している。上記の追加医療機関の過去症例数からは十分に集積可能と考えられ継続中であり、令和7年度中に解析を開始できる見込みである。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

切除標本を使用した一細胞レベルでのオミクス解析に関しては現在、標本集積中であり、解析結果はまだ出ていない。食道癌手術症例が予想を下回っており、共同研究機関を追加し(東北医科薬科大学病院消化器外科及び病理)、標本集積を加速させるべく努力している。

Strategy for Future Research Activity

ゲノム解析領域に関しては論文化したが、さらに新たなコホートを作成して全ゲノム相関解析を発展的に継続している。
切除標本を使用した一細胞レベルでのオミクス解析に関しては現在、標本集積中であり、解析結果はまだ出ていない。集積状況は予想を下回っているため、共同研究機関を追加し、標本集積を加速させるべく努力している。上記の追加医療機関の過去症例数からは十分に集積可能と考えられ継続中である。

Report

(1 results)
  • 2024 Research-status Report
  • Research Products

    (1 results)

All 2024

All Presentation (1 results)

  • [Presentation] A single-nucleotide polymorphism as a predictive marker candidate for platinum-based chemotherapy2024

    • Author(s)
      Takahiro Mori, Masao Nagasaki, Kazuko Ueno.
    • Organizer
      第83回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2024 Research-status Report

URL: 

Published: 2024-04-05   Modified: 2025-12-26  

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