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Exploration of Severe ARDS Pathogenesis Using Proteome Analysis

Research Project

Project/Area Number 24K12183
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 55060:Emergency medicine-related
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

本澤 大志  横浜市立大学, 附属病院, 助教 (90899147)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 佐治 龍  横浜市立大学, 医学部, 助教 (10975080)
西井 基継  横浜市立大学, 医学部, 講師 (20383573)
谷口 隼人  横浜市立大学, 附属市民総合医療センター, 講師 (40833306)
木村 弥生  横浜市立大学, 先端医科学研究センター, 教授 (80391936)
竹内 一郎  横浜市立大学, 医学研究科, 教授 (90327346)
Project Period (FY) 2024-04-01 – 2027-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2026: ¥260,000 (Direct Cost: ¥200,000、Indirect Cost: ¥60,000)
Fiscal Year 2025: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000)
Fiscal Year 2024: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
KeywordsARDS / プロテオーム解析
Outline of Research at the Start

急性呼吸窮迫症候群(Acute Respiratory Distress Syndrome: ARDS)は、致死的な臨床経過を呈し、救急集中治療診療において最も治療に難渋する代表的な疾患である。しかし、”未だにこの病態異質性は十分に理解されていない”。そこで、応募者らは、先行研究としてCOVID-19によるARDS患者の臨床データと共に肺胞洗浄液細胞のトランスクリプトーム解析を行った。本研究では、この結果に基づいて、末梢血タンパクのプロテオーム解析により異質な病態を反映する生物学的マーカーを同定し、ARDSにおける病態の本質をとらえることで個別化治療の基盤構築を目指す。

Outline of Annual Research Achievements

急性呼吸窮迫症候群(Acute Respiratory Distress Syndrome: ARDS)は、致死的な臨床経過を呈し、救急集中治療診療において最も治療に難渋する代表的な疾患である。しかし、”未だにこの病態異質性は十分に理解されていない”。そこの臨床的課題を解決すべく、先行的に新型コロナウイルス感染症によるARDS患者及び非感染患者の肺胞洗浄液細胞におけるトランスクリプトーム情報を臨床情報と共に解析し、病態異質性の探索を行った。
私たちの先行研究では、得られた肺胞洗浄液に含まれる細胞からRNAの抽出を行い、全トランスクリプトーム情報の主成分分析により、ARDS患者をいくつかのクラスターに分類することができた。病態Aは、これまでの免疫応答亢進を主体とした病態である。即ち、気道線毛クリアランス機能の亢進を活用したウイルス感染とその拡散及びRHO-GTPase経路活性化による血管内皮バリア機能低下を介した免疫細胞の肺胞腔内への移動による免疫応答の亢進が主体と考えられた。一方で、非典型的な病態Bとしては、感染ウイルスに対する気道線毛クリアランス機能の低下による肺胞への感染拡大と減弱した免疫応答により、ウイルス複製亢進に伴う過剰な異常タンパク産生亢進による小胞体ストレスと肺胞腔内溶血による遊離ヘムに対する免疫細胞を介した排除機構の低下を生じた。
得られた肺胞洗浄液を用いたプロテオーム解析をすでに実施した。粗解析ではこのプロテオーム解析でも複数のクラスターにARDSを分類できる可能性があり、現在解析中である。先般得られたトランスクリプトーム情報との関連や、臨床情報との関連を順次調べていく方針である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

得られた肺胞洗浄液を用いたプロテオーム解析をすでに実施した。粗解析ではこのプロテオーム解析でも複数のクラスターにARDSを分類できる可能性があり、現在解析中である。先般得られたトランスクリプトーム情報との関連や、臨床情報との関連を順次調べていく方針である。

Strategy for Future Research Activity

現在解析中の、肺胞洗浄液のプロテオーム解析の結果と臨床情報の関連や、私たちの先行研究で明らかになったトランスクリプトーム情報との関連の解析を行っていく。ARDS病態の異質性の探索が目標であり、病態のクラスタリングや病態にとって重要な蛋白質が示唆されれば、ELISA法などを追加して検討を深めていく方針である。
現在、肺胞洗浄液を中心に解析を進めているが、同一症例の末梢血についても検体を得られており、これらを合わせた解析を計画していく。
また、引き続きARDS症例の肺胞洗浄液や末梢血について検体採取を並行して進めていく。

Report

(1 results)
  • 2024 Research-status Report

URL: 

Published: 2024-04-05   Modified: 2025-12-26  

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