空間発現解析による脳腫瘍の形態診断と遺伝子診断の統合による悪性化マーカーの検索

Research Project

Project/Area Number	24K12222
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 56010:Neurosurgery-related
Research Institution	Okayama University
Principal Investigator	駿河和城岡山大学, 大学病院, 医員 (20989719)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	藤井謙太郎岡山大学, 医学部, 客員研究員 (40799318) 大谷理浩岡山大学, 医歯薬学域, 助教 (60902989) 石田穣治岡山大学, 大学病院, 助教 (90771949)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2027-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000) Fiscal Year 2026: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000) Fiscal Year 2025: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000) Fiscal Year 2024: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords	空間トランスクリプトーム
Outline of Research at the Start	脳腫瘍は150種類以上の疾患から成り、特にpilocytic astrocytomaには形態学的には類似しているにも拘わらず治療法や予後が異なる疾患群(pilocytic morphology群)が存在する。形態学的診断を補完する手法として、WHO中枢神経系腫瘍分類第5版よりゲノムワイドメチル化解析を用いた腫瘍分類が追加されたが、その解析結果は検体の質や疾患の稀少性にも大きく左右される。我々は、脳腫瘍診断には形態診断と分子診断の融合が重要と考えており、本研究ではゲノムワイドメチル化解析、空間トランスクリプトーム解析、single cell RNA-seqを用いることで、組織上のheterogeneityに注目した悪性化マーカーの探索、および悪性化機序の解明を行う。