Evaluation of structural variants and splice variants associated with IRD

Research Project

Project/Area Number	24K12796
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 56060:Ophthalmology-related
Research Institution	独立行政法人国立病院機構(東京医療センター臨床研究センター)
Principal Investigator	岡本晶子 (須賀) 独立行政法人国立病院機構(東京医療センター臨床研究センター), 分子細胞生物学研究部, 研究員 (70450400)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2027-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000) Fiscal Year 2026: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000) Fiscal Year 2025: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000) Fiscal Year 2024: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywords	遺伝性網膜疾患 / ゲノム解析 / 有害変異 / 構造変異 / スプライシング
Outline of Research at the Start	本研究では、ゲノム解析により遺伝性網膜疾患（IRD）の原因候補として検出したスプライス変異と遺伝子内の構造変異の有害性をスプライスアッセイおよび患者由来細胞を用いて実験的に検討する。IRDの原因遺伝子変異として非コード領域や構造変異の寄与が示されているが、スプライス変異や遺伝子の一部の構造変異が翻訳産物に与える影響の予測は困難であり、実験的検討が必要である。我々はIRD患者458家系のゲノム解析を行い、原因候補となるスプライス変異及びエクソンの欠失や重複を検出した。有害性の実験的検討によりIRD原因遺伝子解析の同定率向上と発症機序の理解、治療標的の明確化につなげる。