A Comprehensive Characterization of Clinical Isolates of Staphylococcal Small Colony Variant: the Use of Omics Approach

Research Project

Project/Area Number	24K13443
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 58020:Hygiene and public health-related: including laboratory approach
Research Institution	Sapporo Medical University
Principal Investigator	漆原範子札幌医科大学, 医学部, 准教授 (80396308)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	アウンメイジソウ札幌医科大学, 医学部, 講師 (10749584)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2027-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000) Fiscal Year 2026: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000) Fiscal Year 2025: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000) Fiscal Year 2024: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords	SVC / 薬剤耐性 / 持続感染 / 遺伝子変異 / 発現解析
Outline of Research at the Start	small colony variant（SCV）は、増殖が遅く寒天培地上で小型のコロニーを形成する変異株を指す。通常の菌株とは細菌学的な特徴が異なるため、検査の際に見逃しや菌種の同定を誤りやすい。更に一般的な手法で薬剤感受性評価が出来ない等の難点がある。感染症を引き起こすと、抗生剤が効きにくく、治療が長期間に及ぶ傾向がある。本課題では近年技術革新が著しい次世代型シークエンサーを用い、SCVの遺伝子を広範囲に調べ、これらの特徴と関連する変異を見いだす。得られた結果を基に SCV の検出や評価の手法を向上させ、抗生剤の適正使用と感染の制御につなげることを目的とする。