Calculation of three-dimensional functions describing non-conventional molecular interactions and their applications for SBDD/FBDD technologies

Research Project

Project/Area Number	24K15167
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 62010:Life, health and medical informatics-related
Research Institution	Showa University
Principal Investigator	早川大地昭和大学, 薬学部, 講師 (20761141)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2027-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000) Fiscal Year 2026: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000) Fiscal Year 2025: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000) Fiscal Year 2024: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Keywords	非典型分子間相互作用 / in silico SBDD/FBDD
Outline of Research at the Start	ハロゲン結合や弱い水素結合をはじめとした非典型分子間相互作用は、タンパク質構造に基づいた医薬分子設計(SBDD)やFragment-based drug design(FBDD)において考慮する意義のある相互作用である。様々なフラグメント分子について、非典型相互作用が形成される方向と強さ(エネルギー)を知ることができれば、非典型相互作用を考慮したSBDD/FBDDを実施する際に役立つ。本研究では、これらの方向と強さを記述する3次元関数を、量子化学計算に基づいて明らかにする。更に、タンパク質表面に非典型相互作用を介して結合するフラグメント分子を、同３次元関数に基づいて予測する方法を検討する。