Elucidation of turning point and final destination determinants in type II membrane protein subcellular localization pathway

• Project/Area Number: 24K15169
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 62010:Life, health and medical informatics-related
• Research Institution: Meiji University
• Principal Investigator: 池田 有理 明治大学, 理工学部, 専任准教授 (30371082)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 越中谷 賢治 青山学院大学, 理工学部, 助教 (90806499) ; 池田 修己 青山学院大学, 理工学部, 助教 (20415772)
• Project Period (FY): 2024-04-01 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000); Fiscal Year 2026: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000); Fiscal Year 2025: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2024: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
• Keywords: 膜タンパク質 / 膜貫通領域 / 細胞内局在 / バイオインフォマティクス / 実験的検証

Outline of Research at the Start

膜タンパク質の細胞内局在性異常に基づく疾患のメカニズムや、翻訳後修飾などタンパク質の加工・成熟による機能発現を考える上で、細胞内局在化の最終局在位置のみならずその経路が極めて重要であるが、各論ではなくシステマティックに局在化機構と局在経路の関係を論じた研究が存在しない。本研究課題では、膜貫通領域を1本持つII型膜タンパク質を対象に、1)「折り返し地点」および「最終局在位置」（図1）の調査と分類、2) 配列・構造解析による「折り返し地点」決定要因の特定、3)「折り返し地点」決定要因の検証実験、4) 配列・構造解析による「最終局在位置」決定要因の特定、5)「最終局在位置」決定要因の検証実験を行う。