Development of simulation methods for understanding multivalent interactions and avidity in vivo

Research Project

Project/Area Number	24K15182
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 62010:Life, health and medical informatics-related
Research Institution	Kitasato University
Principal Investigator	能登香北里大学, 一般教育部, 准教授 (20361818)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2027-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000) Fiscal Year 2026: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000) Fiscal Year 2025: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000) Fiscal Year 2024: ¥260,000 (Direct Cost: ¥200,000、Indirect Cost: ¥60,000)
Keywords	生体分子間多価相互作用 / アビディティー / シミュレーション / 分子認識機構 / 糖鎖
Outline of Research at the Start	医薬品設計では，生体分子の活性部位における単一リガンドの結合親和性を向上させることを目的としたシミュレーション手法が使用されている．一方，生体内では，多数の弱い親和性をもつリガンドが統合し，高い標的結合親和性を達成するための結合総和力（アビディティ）が関与する系が存在する．本研究では，多価結合による複雑な生体分子認識を標的にしたシミュレーション手法の開発を目指す．糖鎖と多価結合するベロ毒素を研究対象に，詳細な相互作用解析を行い，多価相互作用の定量的評価モデル及びシミュレーション手法の開発を行う．さらに，同様に多価相互作用を有するコレラ毒素についても解析を行い，その汎用性を検討する．