Single-cell RNA-seq analysis of the male gametophyte with induced chromosome breakage by a gametocidal gene in wheat

• Project/Area Number: 24K17877
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 39010:Science in plant genetics and breeding-related
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: 山森 晃一 京都大学, 農学研究科, 特定研究員 (80964577)
• Project Period (FY): 2024-04-01 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2026: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000); Fiscal Year 2025: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000); Fiscal Year 2024: ¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
• Keywords: 配偶子致死 / コムギ / 利己的遺伝因子 / 花粉

Outline of Research at the Start

本研究では、葯から単離した花粉を用いたsingle-cell RNA-seq (scRNA-seq) 解析を行い、染色体切断が起きる花粉とそうでない花粉の発現パターンを直接比較する。
Gc遺伝子は有用遺伝子を持つ異種の染色体断片をコムギに導入する育種ツールとしての利用が期待されている。本研究結果がGc遺伝子の染色体切断に関する新たな知見を提供することは、Gcシステムの制御による効率的なゲノム改変技術への応用につながる。