改良RNA抽出法で検出した新規RNAの転写開始点網羅的同定と細胞内機能解析

Research Project

Project/Area Number	24K18055
Research Category	Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Allocation Type	Multi-year Fund
Review Section	Basic Section 43010:Molecular biology-related
Research Institution	Osaka University
Principal Investigator	藤原奈央子大阪大学, 大学院生命機能研究科, 特任助教(常勤) (90748922)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2026-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000) Fiscal Year 2025: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000) Fiscal Year 2024: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Keywords	新規RNA / lncRNA機能解析 / 転写開始点同定 / CRISPRiノックダウン
Outline of Research at the Start	細胞内のRNAの一部には, 従来よく使われてきたRNA抽出法では抽出困難なものが存在する. 実際に, 難溶性RNAの抽出を可能にした改良RNA抽出法を用いると, 多数の新規難溶性RNAが検出される. しかし, これらのRNAについては, これまで未同定であったために, 機能解析を実施する上で重要となる, 遺伝子構造やRNA配列の全容といった情報を既存のデータから得ることができない. そこで, これら新規RNA分子の転写開始点を網羅的に同定し, この情報に基づいた機能阻害実験を行うことにより, 新規同定した難溶性RNAの細胞内機能を評価する.