タンパク質のダイナミクス予測のための統計力学モデルと深層学習モデルの開発

Research Project

Project/Area Number	24K18078
Research Category	Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Allocation Type	Multi-year Fund
Review Section	Basic Section 43040:Biophysics-related
Research Institution	The University of Tokyo
Principal Investigator	大岡紘治東京大学, 教養学部, 特任助教 (40968260)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2027-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000) Fiscal Year 2026: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000) Fiscal Year 2025: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000) Fiscal Year 2024: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Keywords	タンパク質 / フォールディング反応 / 自由エネルギー地形 / 深層学習
Outline of Research at the Start	タンパク質のダイナミクスの解明は生命科学における重要な課題である。本研究では、我々が構築したタンパク質のフォールディング反応を予測する統計物理学モデルを改良し、タンパク質の結合反応の自由エネルギー地形を予測するモデルの構築を目指す。また、実験的にフォールディング反応などのダイナミクスが調べられているタンパク質について、自由エネルギー地形を計算し、それらのデータベース化やタンパク質の自由エネルギー地形を予測する深層学習モデルの構築を目指す。