Discovery of the extrachromosomal elements in the human microbiome

Research Project

Project/Area Number	24K18092
Research Category	Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Allocation Type	Multi-year Fund
Review Section	Basic Section 43050:Genome biology-related
Research Institution	The University of Tokyo
Principal Investigator	木口悠也東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 特任助教 (40897500)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2026-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000) Fiscal Year 2025: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000) Fiscal Year 2024: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Keywords	染色体外エレメント
Outline of Research at the Start	口腔マイクロバイオームは口腔疾患だけでなく全身の慢性疾患との関与が示唆されている。ヒトマイクロバイオーム内には染色体外エレメント(ECEs)が常在し、遺伝子の水平伝播や特異的な代謝産物の産生などに関与し、近年ヒトの生理・病理との関連が明らかになりつつある。そこで、本研究ではOxford Nanopore PromethIONを用いたロングリードメタゲノム技術を用いることによってこれまで未分類だった口腔内に常在する新規ECEsの発見とその生態学的、機能的特徴の解明を目指す。本成果はこれまで未認識のECEsとヒトの健康との未知の相互作用を明らかにする研究への発展が期待される。