Single DNA molecule analysis of protein association in the mammalian rDNA

Research Project

Project/Area Number	24K18164
Research Category	Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Allocation Type	Multi-year Fund
Review Section	Basic Section 45010:Genetics-related
Research Institution	The University of Tokyo
Principal Investigator	堀優太郎東京大学, 定量生命科学研究所, 助教 (00869365)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2026-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000) Fiscal Year 2025: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000) Fiscal Year 2024: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Keywords	一分子解析 / rDNA / 核小体
Outline of Research at the Start	mRNAからタンパク質の翻訳を行うリボソームの酵素活性はリボソームRNAによって担われている。このためリボソームRNAは細胞の生存のために大量に必要であり、これはリボソームRNA遺伝子が（rDNA）がゲノム上に巨大なリピートを形成することで達成されている。rDNAはコピーによりその転写状態が異なるが、大量に存在するために各ユニットの解析はこれまで難しかった。そこで申請者は一分子シーケンサー解析を通して1ユニットレベルでのrDNAとタンパク質の相互作用を明らかにすることを試みる。