Hybrid traits revealed from the whole transcriptome: The case of the Imperata cylindrica hybrid between ecotypes in Japan

• Project/Area Number: 24K18199
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 45040:Ecology and environment-related
• Research Institution: Ryukoku University
• Principal Investigator: 野村 康之 龍谷大学, 公私立大学の部局等, 研究員 (70847722)
• Project Period (FY): 2024-04-01 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000); Fiscal Year 2026: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000); Fiscal Year 2025: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000); Fiscal Year 2024: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
• Keywords: トランスクリプトーム / 雑種形成 / 開花期 / 可塑性 / 通気組織

Outline of Research at the Start

雑種形成による多様性の増加は、侵略的雑草の出現などの問題を生み出した。雑草問題の解決のためには、雑種の進化生態学的知見の蓄積が不可欠である。本研究は、親生態型には無い特徴を有するチガヤのF1雑種に着目する。本種のF1は気候変動やF2雑種世代以降の出現により、侵略的な系統の出現といった雑草問題を生み出す可能性があり、将来のリスク評価のために追究が必要である。本研究では、2生態型とそのF1について、様々な環境下で全遺伝子発現量を定量し、F1だけで見られる特徴（異なる開花期、大きな可塑性）を生み出す分子基盤を探る。また、F1だけの未知の特徴をトランスクリプトームから予測することを目指す。