Development of an accurate mutation timing estimation method in cancer.

Research Project

Project/Area Number	24K18481
Research Category	Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Allocation Type	Multi-year Fund
Review Section	Basic Section 50010:Tumor biology-related
Research Institution	The University of Tokyo
Principal Investigator	高橋数冴東京大学, 医科学研究所, 助教 (00909385)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2026-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000) Fiscal Year 2025: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000) Fiscal Year 2024: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Keywords	cancer evolution / mutation timing
Outline of Research at the Start	細胞ががん化するプロセスはランダムではなく、特定の順序でがんドライバー遺伝子変異が起こっている可能性がある。つまり、がんを発がん過程における変異の発生順序で分類することで、異なった発がんプロセスごとに分類することができるのではないか？本研究ではこの仮説を確かめるための手法、シークエンスデータから発がん過程の変異順序を解析するための『正確な変異タイミング推定法』の開発に挑戦する。従来の変異タイミング推定法にあった、異なる症例間でがんの変異タイミングが比較できないという問題を解決するため、変異シグネチャーを利用して変異の順序とタイミングを正確に特定することを目指す。