ゲノム解析を用いた原発性硬化性胆管炎からの胆管癌発癌メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number	24K18568
Research Category	Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Allocation Type	Multi-year Fund
Review Section	Basic Section 50020:Tumor diagnostics and therapeutics-related
Research Institution	Chiba University
Principal Investigator	高橋幸治千葉大学, 医学部附属病院, 助教 (40907680)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2026-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000) Fiscal Year 2025: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000) Fiscal Year 2024: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Keywords	原発性硬化性胆管炎 / 胆管癌 / ゲノム
Outline of Research at the Start	原発性硬化性胆管炎から胆管癌が発癌し外科切除を受けた症例またはこれから外科切除を受ける予定の症例と、原発性硬化性胆管炎以外から胆管癌が発癌し外科切除を受けた症例での切除検体について、組織標本をから顕微鏡下に癌部と非癌部の過形成変化、化生性変化、異形成部を分離し、それぞれの部位より核酸抽出を行う。胆膵癌パネルを用いて、抽出した核酸に対しPCRを施行する。PCR産物に処理を行い、ライブラリを作製する。テンプレート調整後、次世代シーケンシングを実施する。ゲノムアノテーション、系統樹解析、PyClone解析を施行し、ゲノム変異の差を比較することで、原発性硬化性からの胆管癌発癌メカニズムを解明する。